RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 PLD5Q8N7P1 536 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 USP6NLQ92738 828 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 PAFAH2Q99487 392 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 TINF2Q9BSI4 451 aa23.58■■□□□ 1.37
KCNS1-202ENST00000537075 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 MGAT5Q09328 741 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SLC1A5Q15758 541 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CA9Q16790 459 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PDIK1LQ8N165 341 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 TEKT4Q8WW24 435 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SPOCK2Q92563 424 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 HCRTO43612 131 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 MAP2K5Q13163 448 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 KRT81Q14533 505 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PDK2Q15119 407 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RNF19AQ9NV58 838 aa23.57■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 TSHRP16473 764 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SPARCL1Q14515 664 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 BOLA3Q53S33 107 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SCYL2Q6P3W7 929 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PCDH19Q8TAB3 1148 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RTP4Q96DX8 246 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 OSMRQ99650 979 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CNTN3Q9P232 1028 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CA4P22748 312 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SDC4P31431 198 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 HDAC4P56524 1084 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CRHR2Q13324 411 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SLC9A4Q6AI14 798 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SESTD1Q86VW0 696 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ZIC5Q96T25 663 aa23.56■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 H7C0C1 242 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ATP5OP48047 213 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PDK4Q16654 411 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PALM2Q8IXS6 379 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 FITM2Q8N6M3 262 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 BEST2Q8NFU1 509 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.55■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RECQL4O94761 1208 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 KRT4P19013 534 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 TGM2P21980 687 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 ELK3P41970 407 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 NCALDP61601 193 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CBLBQ13191 982 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 DNAJC3Q13217 504 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 HIC1Q14526 733 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 RNF43Q68DV7 783 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 NOTUMQ6P988 496 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 UNC93AQ86WB7 457 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 STK32AQ8WU08 396 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 FAF2Q96CS3 445 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 TBCBQ99426 244 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 MDM4O15151 490 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 CHADO15335 359 aa23.54■■□□□ 1.36
KCNS1-202ENST00000537075 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms