RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO43Q4G163 708 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 PRR23BQ6ZRT6 265 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 RMDN1Q96DB5 314 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 K7EQS6 105 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 GREM1O60565 184 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 ATG13O75143 517 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF11P52732 1056 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 TTI2Q6NXR4 508 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 HHIPQ96QV1 700 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 DUSP16Q9BY84 665 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 CYLDQ9NQC7 956 aa25.27■■□□□ 1.64
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PQH9 124 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMA7O14818 248 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 IRF1P10914 325 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ID4P47928 161 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 MORC3Q14149 939 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SCD5Q86SK9 330 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM176AQ96HP8 235 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 BIN1O00499 593 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 MDM4O15151 490 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SEC13P55735 322 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 USP33Q8TEY7 942 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 EXOC4Q96A65 974 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 USP3Q9Y6I4 520 aa25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ADH5P11766 374 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CNR2P34972 360 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CUL2Q13617 745 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SYT13Q7L8C5 426 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 UBR7Q8N806 425 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 NACA2Q9H009 215 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ADH1CP00326 375 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 LRMPQ12912 555 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 STIM1Q13586 685 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 DMC1Q14565 340 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC30AQ86WT1 665 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM25Q86YD3 366 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 NELFBQ8WX92 580 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP63Q96MT8 703 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 GMEB2Q9UKD1 530 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB23Q9ULC3 237 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ATG2BQ96BY7 2078 aa25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TULP2O00295 520 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 RARGP13631 454 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 FMO5P49326 533 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 C2orf27AQ580R0 203 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 PIGZQ86VD9 579 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC39CQ8N584 583 aa25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CACNA1AO00555 2505 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 RETP07949 1114 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 STX17P56962 302 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 KDSRQ06136 332 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SPEM2Q0P670 501 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 HTR3DQ70Z44 454 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP68Q76N32 757 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 NAT16Q8N8M0 369 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 GAB3Q8WWW8 586 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 ACDQ96AP0 544 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 OTUB2Q96DC9 234 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 PNKPQ96T60 521 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.21■■□□□ 1.63
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