RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516254.1

RNU6-1041P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1041, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1041P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TRIM14Q14142 442 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CSHL1Q14406 222 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ACOX1Q15067 660 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TMEM95Q3KNT9 176 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TREML2Q5T2D2 321 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 LCE4AQ5TA78 99 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 FNDC7Q5VTL7 733 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TANGO2Q6ICL3 276 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ERAP2Q6P179 960 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CRIP3Q6Q6R5 217 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 Q6YL49 198 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SPRED1Q7Z699 444 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 GALNT15Q8N3T1 639 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ABHD11Q8NFV4 315 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TBC1D5Q92609 795 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 GLG1Q92896 1179 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SDCCAG3Q96C92 435 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 WDR24Q96S15 920 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TTPALQ9BTX7 342 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ZNF747Q9BV97 191 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 KATNAL1Q9BW62 490 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 MMRN2Q9H8L6 949 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PPCSQ9HAB8 311 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SAYSD1Q9NPB0 183 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SNX15Q9NRS6 342 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SERTAD4Q9NUC0 356 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TMLHEQ9NVH6 421 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 DACT1Q9NYF0 836 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 VPS51Q9UID3 782 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PACSIN3Q9UKS6 424 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 COL4A3Q01955 1670 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 LGALS16A8MUM7 142 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 NPIPB8E9PQR5 432 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 QSOX1O00391 747 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PIP5K1BO14986 540 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PMPCBO75439 489 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 WDR47O94967 919 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ANXA6P08133 673 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 NPSP0C0P6 89 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 FAM163BP0C2L3 166 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TMEM225BP0DP42 221 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TACR2P21452 398 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ADRA1DP25100 572 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ADORA2AP29274 412 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 GKP32189 559 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 MPLP40238 635 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ITGA8P53708 1063 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SEC24CP53992 1094 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PDE1AP54750 535 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 DGCR2P98153 550 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 PPFIA1Q13136 1202 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 EFR3AQ14156 821 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 KCNJ12Q14500 433 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 KCNAB1Q14722 419 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TXNRD1Q16881 649 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TBRG1Q3YBR2 411 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 FAM153CQ494X1 144 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TRIM60Q495X7 471 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 RAP1GAP2Q684P5 730 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SLC9A4Q6AI14 798 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 LAIR1Q6GTX8 287 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 KLHL17Q6TDP4 642 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CLEC9AQ6UXN8 241 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 USP49Q70CQ1 688 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 RAB11FIP2Q7L804 512 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ZNF354CQ86Y25 554 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CERS3Q8IU89 383 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 SFTPA1Q8IWL2 248 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CPXCR1Q8N123 301 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 MYRIPQ8NFW9 859 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 CAGE1Q8TC20 777 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 ACTRT2Q8TDY3 377 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 XAGE5Q8WWM1 108 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1041P-201ENST00000516254 RFKQ969G6 155 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms