RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf21	Q9H246	121 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	POLE3	Q9NRF9	147 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF181	Q9P0P0	153 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		7.09	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	DOCK1	Q14185	1865 aa		7.09	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SYCE3	A1L190	88 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMA7	O14818	248 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PRPSAP2	O60256	369 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO21	O94952	628 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ASGR1	P07306	291 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FES	P07332	822 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CCND1	P24385	295 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJB1	P25685	340 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ANXA13	P27216	316 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GDI1	P31150	447 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX9	P48436	509 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ADCY7	P51828	1080 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	STAT2	P52630	851 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	USP14	P54578	494 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NCOA4	Q13772	614 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	LRP8	Q14114	963 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DOC2B	Q14184	412 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SQLE	Q14534	574 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SPCS2	Q15005	226 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MTFR1	Q15390	333 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	INSC	Q1MX18	579 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MAJIN	Q3KP22	176 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	XKR3	Q5GH77	459 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD1	Q719H9	257 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS36	Q86VN1	386 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL14	Q8N4G2	192 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	KIF18A	Q8NI77	898 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	AGR3	Q8TD06	166 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF139	Q8WU17	664 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SEPT8	Q92599	483 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CUL5	Q93034	780 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL8A	Q96BM9	186 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	MSANTD3	Q96H12	275 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	C7orf34	Q96L11	122 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX27	Q96L92	541 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SGCZ	Q96LD1	299 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	C12orf42	Q96LP6	360 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC25	Q96NG3	672 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FNBP1	Q96RU3	617 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	AMN	Q9BXJ7	453 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CPVL	Q9H3G5	476 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	UCK1	Q9HA47	277 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	GLRX2	Q9NS18	164 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	FEM1B	Q9UK73	627 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
FBXO38-208	ENST00000504971	CFL2	Q9Y281	166 aa		7.08	□□□□□ -1.28

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