RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496840.1

TARDBP-210, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene TARDBP, Length 692 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-210ENST00000496840 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 TMPRSS11DO60235 418 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 HGFP14210 728 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ATF3P18847 181 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 IL1R2P27930 398 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 DIO1P49895 249 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 MZT2AQ6P582 158 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 UNC13DQ70J99 1090 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 KRT78Q8N1N4 520 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.17□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 MT-CO3P00414 261 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 MT-ND5P03915 603 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 CD19P15391 556 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 CREB1P16220 341 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ITGA8P53708 1063 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.16□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 A8MVJ9 347 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 AGPSO00116 658 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 EXOC5O00471 708 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 DGKHQ86XP1 1220 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ZNF398Q8TD17 642 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 PHKBQ93100 1093 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 TTC17Q96AE7 1141 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 SNX22Q96L94 193 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 CCDC17Q96LX7 622 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 VPS51Q9UID3 782 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.15□□□□□ -1.26
TARDBP-210ENST00000496840 TMEM232C9JQI7 657 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 H3BNC9 293 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 GCATO75600 419 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 BCAR3O75815 825 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 STK3Q13188 491 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 CLCA4Q14CN2 919 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 ST3GAL2Q16842 350 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.14□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 TP73O15350 636 aa7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 A1BGP04217 495 aa7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 USP49Q70CQ1 688 aa7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 F8W8V4 182 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 MOSPD3O75425 235 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 MCM5P33992 734 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 PTGER1P34995 402 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 MANEALQ5VSG8 457 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 WDR26Q9H7D7 661 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.12□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 COL15A1P39059 1388 aa7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 SNX2O60749 519 aa7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 RBL1P28749 1068 aa7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 CFHR3Q02985 330 aa7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 DAG1Q14118 895 aa7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 KCNAB1Q14722 419 aa7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 ETFDHQ16134 617 aa7.11□□□□□ -1.27
TARDBP-210ENST00000496840 TMEM65Q6PI78 240 aa7.11□□□□□ -1.27
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