RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 ISM2Q6H9L7 571 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 SYT13Q7L8C5 426 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 TATDN2Q93075 761 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 SLC35C1Q96A29 364 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 UBXN6Q9BZV1 441 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PMM2O15305 246 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ADH5P11766 374 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ID4P47928 161 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 KIF11P52732 1056 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 RAD23BP54727 409 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 GAD2Q05329 585 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 GAB4Q2WGN9 574 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ZNF276Q8N554 614 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PNKPQ96T60 521 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 FAM186AA6NE01 2351 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CYP26A1O43174 497 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 LRP3O75074 770 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 APODP05090 189 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 RETP07949 1114 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CETN1Q12798 172 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CUL2Q13617 745 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 MORC3Q14149 939 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 TTI2Q6NXR4 508 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 HTR3DQ70Z44 454 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CEP68Q76N32 757 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD52Q8NB46 1076 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 USP33Q8TEY7 942 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 NELFBQ8WX92 580 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ARID3AQ99856 593 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 USP3Q9Y6I4 520 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 MYO15AQ9UKN7 3530 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 A0A0A0MRY4 1105 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 A0A1W2PQH9 124 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 K7EQS6 105 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 P4HA2O15460 535 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 APBB3O95704 486 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 GNA14O95837 355 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 RALAP11233 206 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 RARGP13631 454 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 SDHBP21912 280 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PLA2G4AP47712 749 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 FMO5P49326 533 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 PGFP49763 221 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 DMC1Q14565 340 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 LY6G5CQ5SRR4 150 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 GAB3Q8WWW8 586 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 SPHK2Q9NRA0 654 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 OSER1Q9NX31 292 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 NAGPAQ9UK23 515 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-205ENST00000467594 MYH10P35580 1976 aa16.27■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 TBX18O95935 607 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 IRF1P10914 325 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 BMP6P22004 513 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 GRIA2P42262 883 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 TNFRSF4P43489 277 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 SLC6A11P48066 632 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 UBE2HP62256 183 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 FOXK2Q01167 660 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 LMNB2Q03252 620 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
NISCH-205ENST00000467594 LPAL2Q16609 132 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms