RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMYM6O95789 1325 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PCSK5Q92824 1860 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 F5P12259 2224 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 BRINP1O60477 761 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ALDH1L1O75891 902 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CIAO1O76071 339 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PLS3P13797 630 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ACTN2P35609 894 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SOX9P48436 509 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PON2Q15165 354 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR31Q5SQ13 230 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 C11orf74Q86VG3 221 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PALB2Q86YC2 1186 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CERS3Q8IU89 383 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF169Q8NCN4 708 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 DNERQ8NFT8 737 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SEC14L1Q92503 715 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MCRS1Q96EZ8 462 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 IGSF21Q96ID5 467 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 EPN3Q9H201 632 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RGS18Q9NS28 235 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 AKT3Q9Y243 479 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 APCP25054 2843 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PQH9 124 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 WIPF3A6NGB9 483 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 C9orf118A6NHY6 69 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 C22orf46C9J442 243 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 OVOL3O00110 214 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CYR61O00622 381 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TEX28O15482 410 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CBFA2T3O75081 653 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 DGKEP52429 567 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC14A1Q13336 389 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 NCAPHQ15003 741 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 DHRS13Q6UX07 377 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ERICH1Q86X53 443 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CHURC1Q8WUH1 139 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 GAD1Q99259 594 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CLIP2Q9UDT6 1046 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TUBE1Q9UJT0 475 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TRPV2Q9Y5S1 764 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SQORQ9Y6N5 450 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ATRQ13535 2644 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ANO9A1A5B4 782 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 B4E1Z4 1266 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KLK10O43240 276 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ATG13O75143 517 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNH1O95259 989 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 APBB3O95704 486 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 GGPS1O95749 300 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SLPIP03973 132 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 THBDP07204 575 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 JUPP14923 745 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ITGB6P18564 788 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 STAT5AP42229 794 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PTGER3P43115 390 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CLDN6P56747 220 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 FANCCQ00597 558 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 PTH1RQ03431 593 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SCRN1Q12765 414 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 ICAM4Q14773 271 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 GRM4Q14833 912 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 CDSNQ15517 529 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 STXBP2Q15833 593 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 DUOXA1Q1HG43 343 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms