RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 FMO5P49326 533 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SEC13P55735 322 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 MESP2Q0VG99 397 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 CUL2Q13617 745 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 NACA2Q9H009 215 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.61□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PQH9 124 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 TULP2O00295 520 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 CALCAP01258 141 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SLC6A11P48066 632 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 PAK1Q13153 545 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 PPP2R5DQ14738 602 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 DHCR24Q15392 516 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 KAT5Q92993 513 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 CEP63Q96MT8 703 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 HHIPQ96QV1 700 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 DUSP16Q9BY84 665 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 EPC1Q9H2F5 836 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 COMMD8Q9NX08 183 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 HRO43593 1189 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 DRD1P21728 446 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 TUBP50607 506 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 KIF11P52732 1056 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 UBE2HP62256 183 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 AMPD2Q01433 879 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 KDSRQ06136 332 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 NR1H3Q13133 447 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SCD5Q86SK9 330 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 TTC30AQ86WT1 665 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 UBR7Q8N806 425 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 RUBCNQ92622 972 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 NCDNQ9UBB6 729 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 NAGPAQ9UK23 515 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 SCML2Q9UQR0 700 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.58□□□□□ -0.07
PRAME-209ENST00000439106 RARGP13631 454 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 CD19P15391 556 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R2P41236 205 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 NRLP54845 237 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 PIGZQ86VD9 579 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 NAT16Q8N8M0 369 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 CYLDQ9NQC7 956 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 E2F8A0AVK6 867 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 BICDL2A1A5D9 508 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 ADH5P11766 374 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 PDE4CQ08493 712 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 C2orf27AQ580R0 203 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 TMEM270Q6UE05 265 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 LONP2Q86WA8 852 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 LMO3Q8TAP4 145 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 UBA3Q8TBC4 463 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 NT5C1BQ96P26 610 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 MED15Q96RN5 788 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 USP3Q9Y6I4 520 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 SPTBN2O15020 2390 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 K7EQS6 105 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 TRIM24O15164 1050 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 GREM1O60565 184 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms