RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa13.19□□□□□ -0.3
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PRAME-208ENST00000438888 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
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PRAME-208ENST00000438888 DRD1P21728 446 aa13.17□□□□□ -0.3
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF699Q32M78 642 aa13.17□□□□□ -0.3
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PRAME-208ENST00000438888 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.34e-8■■■■■ 65.3
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PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PQJ5 194 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 UCHL3P15374 230 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 BDNFP23560 247 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 LMO2P25791 158 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 GRIK1P39086 918 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-208ENST00000438888 MPLP40238 635 aa13.16□□□□□ -0.3
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