RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	MED10	Q9BTT4	135 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT82	Q9NSB4	513 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		18.79	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	AP1G2	O75843	785 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	RHOBTB1	O94844	696 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	NFATC1	O95644	943 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	PROS1	P07225	676 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ORC1	Q13415	861 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ELF2	Q15723	593 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf29	Q8N999	325 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC16	Q8NEE8	873 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	GSDMA	Q96QA5	445 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	HHIP	Q96QV1	700 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	TWNK	Q96RR1	684 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	LAMA1	P25391	3075 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	FRY	Q5TBA9	3013 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ATRX	P46100	2492 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ABL1	P00519	1130 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2H1	P32780	548 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	PRCP	P42785	496 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	TUB	P50607	506 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	NR1H3	Q13133	447 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT39	Q6A163	491 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	SYT13	Q7L8C5	426 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	WHAMM	Q8TF30	809 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	RMND1	Q9NWS8	449 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	EBF1	Q9UH73	591 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
MRPL28-203	ENST00000429738	COCH	O43405	550 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CILP	O75339	1184 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	APBB3	O95704	486 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CAVIN2	O95810	425 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP17A1	P05093	508 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	OPRD1	P41143	372 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CREB5	Q02930	508 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEAL3	Q969E4	200 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	TIGD1	Q96MW7	591 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	18.76	■□□□□ 0.59	1e-6	■■■■■ 61.4
MRPL28-203	ENST00000429738	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	HHLA1	C9JL84	531 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	DCLK1	O15075	740 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CETN3	O15182	167 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K7CL	P57077	242 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	HECTD3	Q5T447	861 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	SEMA4D	Q92854	862 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	EDEM2	Q9BV94	578 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	GMIP	Q9P107	970 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	E2F8	A0AVK6	867 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	C4orf47	A7E2U8	309 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	PGF	P49763	221 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	MXI1	P50539	228 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	DMC1	Q14565	340 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	DHCR24	Q15392	516 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	ACD	Q96AP0	544 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP205	Q92621	2012 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	IGF2R	P11717	2491 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	ADORA2B	P29275	332 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MRPL28-203	ENST00000429738	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59

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