RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 LRCH4O75427 683 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 KRT37O76014 449 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 ERBB2P04626 1255 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 OSBPP22059 807 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 RFX1P22670 979 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 ANXA13P27216 316 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 PRAMEP78395 509 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 CENPCQ03188 943 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 STX3Q13277 289 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 SEPT6Q14141 434 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 C4orf19Q8IY42 314 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 C10orf82Q8WW14 230 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 LGMNQ99538 433 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 MED10Q9BTT4 135 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 TP73O15350 636 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 GRIN3BO60391 1043 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 PSMG1O95456 288 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 HSPA4LO95757 839 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 T-ENOLP0DO92 83 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 ETFBP38117 255 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 VHLP40337 213 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 CAV1Q03135 178 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 SLC12A1Q13621 1099 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 DPYSL3Q14195 570 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 DLG2Q15700 870 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 TREML1Q86YW5 311 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 RNF217Q8TC41 542 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 KIF12Q96FN5 646 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 USP54Q70EL1 1684 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.65□□□□□ -1.02
SNX13-201ENST00000409076 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 VWA5AO00534 786 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PSTPIP1O43586 416 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 OATP04181 439 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ZNF286BP0CG31 522 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 KDELR1P24390 212 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PLK1P53350 603 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 GBE1Q04446 702 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 STXBP2Q15833 593 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 MFSD5Q6N075 450 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SPATA33Q96N06 139 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TTC25Q96NG3 672 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PIF1Q9H611 641 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.65□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 GSC2O15499 205 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TSPAN3O60637 253 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 AMHP03971 560 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 GCAP28676 217 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 XKR3Q5GH77 459 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PID1Q7Z2X4 250 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 NENFQ9UMX5 172 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 A0A087WZ62 844 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ITM2AO43736 263 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SUPT3HO75486 399 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 AKAP5P24588 427 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 ADORA2AP29274 412 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SDC4P31431 198 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 CCNFP41002 786 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 NCKAP1LP55160 1127 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.64□□□□□ -1.03
SNX13-201ENST00000409076 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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