RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 CRYMQ14894 314 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CTXN3Q4LDR2 81 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 KRT78Q8N1N4 520 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CAAP1Q9H8G2 361 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 RBP1P09455 135 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 ITIH4Q14624 930 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SLC15A2Q16348 729 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SYTL2Q9HCH5 934 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 PXMP2Q9NR77 195 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SLC25A13Q9UJS0 675 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CYTH3O43739 400 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CRTAMO95727 393 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 MYL6P60660 151 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 PRKCQQ04759 706 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 FBXO25Q8TCJ0 367 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 JADE3Q92613 823 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 NDEL1Q9GZM8 345 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SCUBE2Q9NQ36 999 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SPACA6W5XKT8 324 aa19.1■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SEL1L3Q68CR1 1132 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 ACOT9Q9Y305 439 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 KANSL1LA0AUZ9 987 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 JCHAINP01591 159 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SEC23AQ15436 765 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 RXFP2Q8WXD0 754 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SLCO1B7G3V0H7 640 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SERPINB3P29508 390 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SERPINB5P36952 375 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 MMP14P50281 582 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CHRNB3Q05901 458 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 ZNF284Q2VY69 593 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 FUT11Q495W5 492 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 IYDQ6PHW0 289 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SV2AQ7L0J3 742 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SLC24A2Q9UI40 661 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 MYO3AQ8NEV4 1616 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 TTLL13PA6NNM8 815 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 PSMA3P25788 255 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CDC16Q13042 620 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CCDC142Q17RM4 750 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 STRA8Q7Z7C7 330 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 FUCA2Q9BTY2 467 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.09■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 TCF3P15923 654 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 GRK2P25098 689 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 GLRBP48167 497 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 EFEMP1Q12805 493 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 METTL7BQ6UX53 244 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 TMBIM4Q9HC24 238 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 OSGEPQ9NPF4 335 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 USE1Q9NZ43 259 aa19.08■□□□□ 0.65
USP25-204ENST00000400183 SLC12A8A0AV02 714 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 DCDC2CA8MYV0 355 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 NCAM2O15394 837 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 TOMM70O94826 608 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 BFSP2Q13515 415 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 CCDC81Q6ZN84 652 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 SLC47A2Q86VL8 602 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 LACRTQ9GZZ8 138 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 SEPT3Q9UH03 358 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 RAP1GAPP47736 663 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 MAP3K7CLP57077 242 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 CYP51A1Q16850 503 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 GALNTL6Q49A17 601 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 C11orf63Q6NUN7 778 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 CARNMT1Q8N4J0 409 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 FICDQ9BVA6 458 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 VPS28Q9UK41 221 aa19.08■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 RHOCP08134 193 aa19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 GPC1P35052 558 aa19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 MPP3Q13368 585 aa19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 OTOAQ7RTW8 1153 aa19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 CPB2Q96IY4 423 aa19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 APOL2Q9BQE5 337 aa19.07■□□□□ 0.64
USP25-204ENST00000400183 PALMDQ9NP74 551 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms