RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 RRM1P23921 792 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 RINLQ6ZS11 566 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 STKLD1Q8NE28 680 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 GMCL1Q96IK5 515 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 FCHO1O14526 889 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D12O60347 775 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 FKBP6O75344 327 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 IFNA14P01570 189 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ATP1A4Q13733 1029 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 BMPR2Q13873 1038 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 COG2Q14746 738 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 NCF4Q15080 339 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 PNMA5Q96PV4 448 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 FAM49BQ9NUQ9 324 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ATRNO75882 1429 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 H3BMM5 538 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 SOAT2O75908 522 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 AKAP3O75969 853 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF23P17027 643 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ACADSBP45954 432 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 CCT8P50990 548 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 RBP5P82980 135 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRM-202ENST00000400053 STYK1Q6J9G0 422 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRM-202ENST00000400053 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 UBA3Q8TBC4 463 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 VPS33AQ96AX1 596 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRM-202ENST00000400053 C2CD2Q9Y426 696 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRM-202ENST00000400053 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRM-202ENST00000400053 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRM-202ENST00000400053 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 MCM8Q9UJA3 840 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRM-202ENST00000400053 RNF103O00237 685 aa9.15□□□□□ -0.95
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PTPRM-202ENST00000400053 USP1O94782 785 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 SULT1E1P49888 294 aa9.15□□□□□ -0.95
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PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ2P63252 427 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.15□□□□□ -0.95
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PTPRM-202ENST00000400053 RIN3Q8TB24 985 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 FANCEQ9HB96 536 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.15□□□□□ -0.95
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PTPRM-202ENST00000400053 MTMR2Q13614 643 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 PCSK7Q16549 785 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.14□□□□□ -0.95
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PTPRM-202ENST00000400053 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 KRT84Q9NSB2 600 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 CD274Q9NZQ7 290 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 MBD2Q9UBB5 411 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRM-202ENST00000400053 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
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