RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TULP2O00295 520 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 INPPL1O15357 1258 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CST8O60676 142 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FKTNO75072 461 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 GRAP2O75791 330 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ENDOD1O94919 500 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FBXO21O94952 628 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 LCP1P13796 627 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 KLRC2P26717 231 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CDH6P55285 790 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CAP1Q01518 475 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF844Q08AG5 666 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TUSC3Q13454 348 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 UPP1Q16831 310 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PCGF5Q86SE9 256 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PIGZQ86VD9 579 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FUKQ8N0W3 1084 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 RNF169Q8NCN4 708 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF670Q9BS34 389 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PQY0 241 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CASTOR2A6NHX0 329 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 KBTBD13C9JR72 458 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 H0YGN5 161 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SGK1O00141 431 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SMAPO00193 183 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MAP3K7O43318 606 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 HCRTO43612 131 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 DAB1O75553 588 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 EOMESO95936 686 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CKBP12277 381 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TGM2P21980 687 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 IVDP26440 423 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 GRK4P32298 578 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ARSEP51690 589 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CDR1P51861 262 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ITGA8P53708 1063 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ATP11AP98196 1134 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ADCY2Q08462 1091 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 KRT71Q3SY84 523 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TTMPQ5BVD1 217 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 STRADAQ7RTN6 431 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ACTL9Q8TC94 416 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PEBP4Q96S96 227 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 RGS18Q9NS28 235 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 KRT82Q9NSB4 513 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 NFS1Q9Y697 457 aa11.63□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MGEA5O60502 916 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 B3GAT3O94766 335 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CYP11A1P05108 521 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MATKP42679 507 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 LMAN1P49257 510 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 DYNLT1P63172 113 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ADIGQ0VDE8 80 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 DPYSL3Q14195 570 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MORF4L2Q15014 288 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 P3H1Q32P28 736 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 TRNP1Q6NT89 227 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 FAM35AQ86V20 835 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC25Q86WR0 208 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 URGCPQ8TCY9 931 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 P3H4Q92791 437 aa11.62□□□□□ -0.55
CTXN3-202ENST00000395322 ARL8AQ96BM9 186 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms