RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 ATG13O75143 517 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 OPRD1P41143 372 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 FBXO43Q4G163 708 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CBWD6Q4V339 395 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 TATDN2Q93075 761 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 SLC35C1Q96A29 364 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 TUBP50607 506 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CETN1Q12798 172 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 DHCR24Q15392 516 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 CISHQ9NSE2 258 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 RAB23Q9ULC3 237 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-201ENST00000378543 EML5Q05BV3 1969 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 E2F8A0AVK6 867 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 P4HA2O15460 535 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 ID4P47928 161 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CAMK4Q16566 473 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 WDR5BQ86VZ2 330 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 MLKLQ8NB16 471 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 WBP2Q969T9 261 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 ARID3AQ99856 593 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SCML2Q9UQR0 700 aa24.82■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 FRYLO94915 3013 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TLR5O60602 858 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CNR2P34972 360 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 OSER1Q9NX31 292 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D14Q9P2M4 693 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.81■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 ANTXRLA6NF34 631 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CYP26A1O43174 497 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TBX18O95935 607 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SLC6A11P48066 632 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 RAD23BP54727 409 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 DUSP16Q9BY84 665 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 NACA2Q9H009 215 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 NMUR1Q9HB89 426 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 GMEB2Q9UKD1 530 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa24.8■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 K7EQS6 105 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC192P0DO97 292 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 IRF1P10914 325 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 FMO5P49326 533 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 LAIR1Q6GTX8 287 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 RMDN1Q96DB5 314 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 ADH5P11766 374 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TGM1P22735 817 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 KIF11P52732 1056 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 MESP2Q0VG99 397 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SYT13Q7L8C5 426 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 C12orf40Q86WS4 652 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 BBS7Q8IWZ6 715 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 OTUB2Q96DC9 234 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 HHIPQ96QV1 700 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 PARD6AQ9NPB6 346 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CYLDQ9NQC7 956 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SPAG17Q6Q759 2223 aa24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CEP250Q9BV73 2442 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1W2PQH9 124 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 ADH1CP00326 375 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SEC13P55735 322 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 DMC1Q14565 340 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 CEP68Q76N32 757 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 SFTPA1Q8IWL2 248 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 USP33Q8TEY7 942 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-201ENST00000378543 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms