RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.6□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.6□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTPRDP23468 1912 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SGK1O00141 431 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLDN5O00501 218 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 APOL1O14791 398 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 HOXA2O43364 376 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAPPC3O43617 180 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 GABBR2O75899 941 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ENDOD1O94919 500 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC34A2O95436 690 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 RARGP13631 454 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 BRCC3P46736 316 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARSEP51690 589 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TKTL1P51854 596 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ITGA8P53708 1063 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADCY2Q08462 1091 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPYSL3Q14195 570 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAF5Q15542 800 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TERF2Q15554 542 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ERMARDQ5T6L9 678 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABI1Q8IZP0 508 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PIK3R5Q8WYR1 880 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 P3H4Q92791 437 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYLPFQ96A32 169 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCED1BQ96HM7 432 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM118BQ9BPY3 351 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM204AQ9H8W3 233 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 RRN3Q9NYV6 651 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEU2Q9Y3R4 380 aa13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYBPHLA2RUH7 354 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CFAP69A5D8W1 941 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMAPO00193 183 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PITPNM1O00562 1244 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAPN9O14815 690 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 NUDT17P0C025 328 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLRC2P26717 231 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS41P49754 854 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDK7P50613 346 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 HDAC4P56524 1084 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ROR1Q01973 937 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADCY1Q08828 1119 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 MBTPS1Q14703 1052 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 P3H1Q32P28 736 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC25A52Q3SY17 297 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGBL2Q5U5Z8 902 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC25Q86WR0 208 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB106AQ8N104 65 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SH3TC2Q8TF17 1288 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 IRGQQ8WZA9 623 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF157Q96PX1 679 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 POPDC2Q9HBU9 364 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PSD3Q9NYI0 1048 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRFN2Q9ULH4 789 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 AP4E1Q9UPM8 1137 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.58□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 A6NNZ2 444 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 I3L4J1 428 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 CD48P09326 243 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 IVDP26440 423 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARL4AP40617 200 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 AIF1P55008 147 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 BCAR1P56945 870 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAOAP59103 153 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 HTRA3P83110 453 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DSC1Q08554 894 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 GPS1Q13098 491 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 MORF4L2Q15014 288 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOMO1Q15155 1222 aa13.57□□□□□ -0.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPYSL2Q16555 572 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms