RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 KCNA3P22001 575 aa21.78■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 ATP6V1E1P36543 226 aa21.78■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.78■■□□□ 1.08
SMURF1-201ENST00000361125 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.78■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.77■■□□□ 1.08
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SMURF1-201ENST00000361125 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.76■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 EME1Q96AY2 570 aa21.76■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 SUPT7LO94864 414 aa21.75■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.75■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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SMURF1-201ENST00000361125 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 CXCL11O14625 94 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 HOXA2O43364 376 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 FUT11Q495W5 492 aa21.75■■□□□ 1.07
SMURF1-201ENST00000361125 PAFAH2Q99487 392 aa21.75■■□□□ 1.07
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