RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP290O15078 2479 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A0C4DFX4 3053 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLIC2O15247 247 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DGAT1O75907 488 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MMP3P08254 477 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RARBP10826 455 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BMP4P12644 408 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LSP1P33241 339 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EMC2Q15006 297 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLCB4Q15147 1175 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TAF5Q15542 800 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TESK1Q15569 626 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADSSL1Q8N142 457 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRPV1Q8NER1 839 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BICD1Q96G01 975 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CGRRF1Q99675 332 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.86□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCE2BO14633 110 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLITRK5O94991 958 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LYPLA2O95372 231 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GJB1P08034 283 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INSRRP14616 1297 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GAP43P17677 238 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ENPP1P22413 925 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRK3P35626 688 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLCN3P51790 818 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF4P78317 190 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BTKQ06187 659 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RETSATQ6NUM9 610 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 P2RX5Q93086 422 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM167AQ96KS9 214 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXL18Q96ME1 805 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLRP4Q96MN2 994 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MIPEPQ99797 713 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SETD4Q9NVD3 440 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFNKQ9P0W0 207 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHISA3A0PJX4 238 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BICDL2A1A5D9 508 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HBP1O60381 514 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GFPT2O94808 682 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALBP02768 609 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLRC1P26715 233 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CPT1AP50416 773 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP2J2P51589 502 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF11P52732 1056 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBASH3AP57075 661 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DRP2Q13474 957 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UVSSAQ2YD98 709 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA1Q5VX52 437 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DAW1Q8N136 415 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS16Q9H269 839 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCND2Q9NZV8 630 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.85□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL6A3P12111 3177 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYADML2A6NDP7 307 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AP5Z1O43299 807 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMGCRP04035 888 aa6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSHRP16473 764 aa6.84□□□□□ -1.31
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