RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 CHN1P15882 459 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 VCAM1P19320 739 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CAPZA1P52907 286 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 INHBEP58166 350 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CHRNB3Q05901 458 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PDCLQ13371 301 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 P3H2Q8IVL5 708 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 MED10Q9BTT4 135 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ANO3Q9BYT9 981 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TNS2Q63HR2 1409 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1G2O95670 118 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB9Q96C00 473 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 NLRP4Q96MN2 994 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 COL6A2P12110 1019 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 CPNE1Q99829 537 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 MTERF2Q49AM1 385 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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