RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 GLRA3O75311 464 aa23.1■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 RANBP1P43487 201 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CYP24A1Q07973 514 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM245Q9H330 911 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 GRIK4Q16099 956 aa23.07■■□□□ 1.28
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