RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328333.12

COL7A1-201, Transcript of collagen type VII alpha 1 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL7A1, Length 9,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL7A1-201ENST00000328333 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 MPOP05164 745 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 FIGNQ5HY92 759 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 POTEHQ6S545 545 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 A0A1W2PRG6 482 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 GJA8P48165 433 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 SULT1E1P49888 294 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 SLC9A5Q14940 896 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 EXD1Q8NHP7 514 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 WWOXQ9NZC7 414 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 ZBTB39O15060 712 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 CLTBP09497 229 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 SOAT1P35610 550 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 NCOA4Q13772 614 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 B3GALT6Q96L58 329 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 C9orf72Q96LT7 481 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 EURLQ9NYK6 297 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 RARBP10826 455 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 NR2C2P49116 596 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 CCNG1P51959 295 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 CHID1Q9BWS9 393 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.71□□□□□ -0.05
COL7A1-201ENST00000328333 ATP9BO43861 1147 aa14.71□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.71□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MCM8Q9UJA3 840 aa14.71□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ALDH1A1P00352 501 aa14.71□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CAPGP40121 348 aa14.71□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.71□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ATP12AP54707 1039 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 DCLK3Q9C098 648 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CYLDQ9NQC7 956 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 IRAK3Q9Y616 596 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ALDH1A2O94788 518 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SASH1O94885 1247 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PAX7P23759 505 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 NEK5Q6P3R8 708 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SHC4Q6S5L8 630 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 C17orf50Q8WW18 174 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SLC16A4O15374 487 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 EXTL3O43909 919 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MTF1Q14872 753 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MYLPFQ96A32 169 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 STX12Q86Y82 276 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 FYNP06241 537 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 GYS1P13807 737 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 UBDO15205 165 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TBC1D12O60347 775 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 AKR1B1P15121 316 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PDGFRAP16234 1089 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PSMB9P28065 219 aa14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms