RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263598.6

LCN1-201, Transcript of lipocalin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LCN1, Length 776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1-201ENST00000263598 A0A1W2PQD8 194 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CLDN5O00501 218 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 ARHGAP33O14559 1287 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 NDUFS2O75306 463 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 ATICP31939 592 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SLC14A1Q13336 389 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 PSMD6Q15008 389 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CHPFQ8IZ52 775 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 RDH13Q8NBN7 331 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 TNIP3Q96KP6 325 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CGRRF1Q99675 332 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 MED10Q9BTT4 135 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 PANK2Q9BZ23 570 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 COMMD8Q9NX08 183 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.5□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 PHACTR2O75167 634 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CLSTN1O94985 981 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CD59P13987 128 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 GNSP15586 552 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 WASP42768 502 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SLC5A3P53794 718 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 AMPD3Q01432 767 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 TMEM25Q86YD3 366 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 PDILTQ8N807 584 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 FOXJ1Q92949 421 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 KCNK16Q96T55 309 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 TNMDQ9H2S6 317 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 NME7Q9Y5B8 376 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 ZZEF1O43149 2961 aa9.49□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 A0A087X0B3 334 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 A0A1W2PQF6 199 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CACNG3O60359 315 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 IRF1P10914 325 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 NDUFV2P19404 249 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CYP2J2P51589 502 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 MYL6P60660 151 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 FAM193AP78312 1265 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CYP24A1Q07973 514 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SLC39A14Q15043 492 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 HTR3DQ70Z44 454 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 FAM35AQ86V20 835 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 PROSER1Q86XN7 944 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 HPS3Q969F9 1004 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 GABRG3Q99928 467 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 BBS2Q9BXC9 721 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 CUEDC2Q9H467 287 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 FBXO44Q9H4M3 255 aa9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LCN1-201ENST00000263598 IL37Q9NZH6 218 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms