RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 GAS7O60861 476 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SIN3BO75182 1162 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 E2F6O75461 281 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CDK18Q07002 472 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 C16orf72Q14CZ0 275 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 PPM1NQ8N819 430 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 GIPC3Q8TF64 312 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TFPTP0C1Z6 253 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 HOXD12P35452 270 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 NRLP54845 237 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 BMPR2Q13873 1038 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ADRM1Q16186 407 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 USP41Q3LFD5 358 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 POTEHQ6S545 545 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ZNF778Q96MU6 729 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.05■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ITM2AO43736 263 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 PSMD7P51665 324 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 UBXN2AP68543 259 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CDKL1Q00532 357 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 STX3Q13277 289 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 NFIXQ14938 502 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 PACS1Q6VY07 963 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 RSPH3Q86UC2 560 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 NLRP4Q96MN2 994 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 F8VP50 259 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ECE1P42892 770 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 GJA8P48165 433 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ANKDD1AQ495B1 522 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SV2AQ7L0J3 742 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 FBXO11Q86XK2 927 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ACTL9Q8TC94 416 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 MKL1Q969V6 931 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 RRN3Q9NYV6 651 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.04■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 KLHL2O95198 593 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 THRAP10827 490 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CPA3P15088 417 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SLF2Q8IX21 1173 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SBF2Q86WG5 1849 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 BIRC5O15392 142 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TOM1L1O75674 476 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CDKN2BP42772 138 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CYTH1Q15438 398 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 GALNT4Q8N4A0 578 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CFAP36Q96G28 342 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 LRGUKQ96M69 825 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 PLGRKTQ9HBL7 147 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 TMEM247A6NEH6 219 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SERPINB7O75635 380 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 FBXO21O94952 628 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 BPGMP07738 259 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 HSPA1LP34931 641 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 NOMO3P69849 1222 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 KCTD21Q4G0X4 260 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SLFN13Q68D06 897 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 SCINQ9Y6U3 715 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-201ENST00000234111 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms