RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnj2P35561 428 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr2fP61219 127 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stt3bQ3TDQ1 823 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SynaQ5G5D5 617 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hsf5Q5ND04 624 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lamb3Q61087 1168 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep70Q6IQY5 616 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q6PD19 689 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asic3Q6X1Y6 530 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem169Q8BG50 297 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slco2b1Q8BXB6 683 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifi205aQ8CGE8 404 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CtbsQ8R242 366 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taf12Q8VE65 161 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1353Q8VGU8 309 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf622Q91VY9 476 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gemin2Q9CQQ4 269 aa22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhox3cA2AWM0 215 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ces1bD3Z5G7 567 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21293E9Q4G9 266 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-T24F8VQG4 363 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhox3hL7MU37 215 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kifc3O35231 824 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc2a4P14142 509 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 UrosP51163 265 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adamts8P57110 905 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gabrb2P63137 512 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smarcad1Q04692 1021 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krt80Q0VBK2 452 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhox3aQ4TU90 215 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CttnQ60598 546 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Satb1Q60611 764 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh3gl1Q62419 368 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Anp32cQ64G17 123 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defb34Q7TNV8 81 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Neto2Q8BNJ6 525 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mcoln2Q8K595 566 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nle1Q8VEJ4 485 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fads1Q920L1 447 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cpxm2Q9D2L5 764 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddit4Q9D3F7 229 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kbtbd12Q9D618 625 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klra17Q9JMA4 273 aa22.9■■□□□ 1.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfhx2Q2MHN3 2562 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp35M0QWN7 1009 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxm1O08696 760 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp8b1O88962 500 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LipeP54310 759 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CtswP56203 371 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxp2P58463 714 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmtc1Q3UV71 942 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dzip1lQ499E4 774 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kcnf1Q7TSH7 493 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Shc2Q8BMC3 573 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc17Q8CE13 565 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rell1Q8K2J7 272 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dusp19Q8K4T5 220 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mlf2Q99KX1 247 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DlstQ9D2G2 454 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Erich6bQ9D4S6 220 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scamp5Q9JKD3 235 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adamts5Q9R001 930 aa22.89■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3127E9Q9P5 263 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3453K7N724 263 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ptp4a2O70274 167 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SrgnP13609 152 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxd12P23812 268 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mxi1P50540 228 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp791Q497V9 528 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1080Q7TR67 313 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MtrrQ8C1A3 696 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp566Q8VCI1 386 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lims2Q91XD2 341 aa22.88■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp4a12bA2A974 508 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CaluO35887 315 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Xirp1O70373 1129 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2afzP0C0S6 128 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnfrsf4P47741 272 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HpdP49429 393 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp46P62069 366 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zhx1P70121 873 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Irf7P70434 457 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2afvQ3THW5 128 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prdm6Q3UZD5 596 aa22.87■■□□□ 1.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bdkrb1Q61125 334 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31 ms