RNA–Protein interactions for RNA: YLL035W

GRC3, Transcript of Polynucleotide kinase present on rDNA, yeast

Gene GRC3, Length 1,899 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRC3	YLL035W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	KEX1	P09620	729 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	CPS1	P27614	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	NNF1	P47149	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	ATF2	P53296	535 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	TIM50	Q02776	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	SPO19	Q03029	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	GYP5	Q12344	894 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	RPO31	P04051	1460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	DNF1	P32660	1571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	PET123	P17558	318 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	LAM1	P38851	1228 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	RNH70	P53331	553 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	INP2	Q03824	705 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	GYL1	Q04322	720 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	NKP1	Q12493	238 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GRC3	YLL035W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YME2	P32843	850 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SEC61	P32915	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	BCK2	P33306	851 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	BEM4	P39011	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ALD2	P47771	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HST1	P53685	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	AOS1	Q06624	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HAT1	Q12341	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	PET100	P38958	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RSM25	P40496	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	POL32	P47110	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ATH1	P48016	1211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SHE4	P51534	789 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HUL5	P53119	910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	PSR1	Q07800	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CAT8	P39113	1433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ERG12	P07277	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	DCW1	P36091	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	MRPL10	P36520	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	DAN4	P47179	1161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YGL082W	P53155	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ATG2	P53855	1592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	MNR2	P35724	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HOT1	Q03213	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TAF13	P11747	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ELM1	P32801	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
GRC3	YLL035W	TTI1	P36097	1038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RFC5	P38251	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	IPL1	P38991	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SPR3	P41901	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SUM1	P46676	1062 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HST2	P53686	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	SLX4	Q12098	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	ERC1	P38767	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
GRC3	YLL035W	NPA3	P47122	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	CIR2	Q08822	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HTA2	P04912	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TSR4	P25040	408 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	GUT1	P32190	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	RPC37	P36121	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	AIM21	P40563	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	YJR142W	P47173	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GRC3	YLL035W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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