RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 CDK19Q9BWU1 502 aa16.48■□□□□ 0.23
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PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGEF11O15085 1522 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-205ENST00000641549 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.48■□□□□ 0.23
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PTPRVP-205ENST00000641549 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.37■□□□□ 0.21
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PTPRVP-205ENST00000641549 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
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PTPRVP-205ENST00000641549 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 SPG7Q9UQ90 795 aa16.33■□□□□ 0.2
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PTPRVP-205ENST00000641549 MCTP1Q6DN14 999 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 GNAI2P04899 355 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 HIP1O00291 1037 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC4A3P48751 1232 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRVP-205ENST00000641549 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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