RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629904.2

PKP4-AS1-203, PKP4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4-AS1, Length 1,951 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ABCC11Q96J66 1382 aa21.68■■□□□ 1.06
PKP4-AS1-203ENST00000629904 DLC1Q96QB1 1528 aa21.68■■□□□ 1.06
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.66■■□□□ 1.06
PKP4-AS1-203ENST00000629904 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.65■■□□□ 1.06
PKP4-AS1-203ENST00000629904 LTKP29376 864 aa21.64■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.63■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.62■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CDK19Q9BWU1 502 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 EID1Q9Y6B2 187 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.61■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.59■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.58■■□□□ 1.05
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SLIT1O75093 1534 aa21.58■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SIRT1Q96EB6 747 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 INSRP06213 1382 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 USP32Q8NFA0 1604 aa21.57■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TECPR2O15040 1411 aa21.56■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 MORC1Q86VD1 984 aa21.56■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NEFLP07196 543 aa21.56■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 A0A1W2PP64 1363 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 FKBP8Q14318 412 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.55■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.54■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.53■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CPS1P31327 1500 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 MED14O60244 1454 aa21.52■■□□□ 1.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CABP1Q9NZU7 370 aa21.51■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NSD2O96028 1365 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.5■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NUDCQ9Y266 331 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TBX22Q9Y458 520 aa21.48■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PTPRUQ92729 1446 aa21.45■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.43■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ATP7BP35670 1465 aa21.43■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.43■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 FYB1O15117 783 aa21.42■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 MTHFSP49914 203 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PDE3BQ13370 1112 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 DIP2AQ14689 1571 aa21.41■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.4■■□□□ 1.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.38■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CFAP53Q96M91 514 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ADGRB2O60241 1585 aa21.37■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.36■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PTCH1Q13635 1447 aa21.36■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.35■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.34■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.33■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.33■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SHPRHQ149N8 1683 aa21.33■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PIK3R4Q99570 1358 aa21.32■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 APAF1O14727 1248 aa21.31■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NUTM2FA1L443 756 aa21.3■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 KCNA6P17658 529 aa21.3■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.28■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ZNF521Q96K83 1311 aa21.28■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.27■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NME9Q86XW9 330 aa21.27■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.27■■□□□ 1
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.27■□□□□ 0.99
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ITSN1Q15811 1721 aa21.26■□□□□ 0.99
PKP4-AS1-203ENST00000629904 AKAP12Q02952 1782 aa21.26■□□□□ 0.99
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.25■□□□□ 0.99
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RUNDC1Q96C34 613 aa21.25■□□□□ 0.99
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.25■□□□□ 0.99
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ACEP12821 1306 aa21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms