RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 GGT6Q6P531 493 aa17.47■□□□□ 0.39
C9orf170-201ENST00000623052 E9PSI1 815 aa17.45■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 MYO5BQ9ULV0 1848 aa17.45■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 RICTORQ6R327 1708 aa17.44■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf34Q49A92 452 aa17.44■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 WWC1Q8IX03 1113 aa17.44■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
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C9orf170-201ENST00000623052 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
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C9orf170-201ENST00000623052 RAPGEF3O95398 923 aa17.4■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 MORC1Q86VD1 984 aa17.4■□□□□ 0.38
C9orf170-201ENST00000623052 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
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C9orf170-201ENST00000623052 ADGRB2O60241 1585 aa17.39■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 IGHDP01880 384 aa17.39■□□□□ 0.37
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C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa17.37■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.36■□□□□ 0.37
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C9orf170-201ENST00000623052 FAM161AQ3B820 660 aa17.36■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa17.36■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 TCP11L2Q8N4U5 519 aa17.36■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 PANK1Q8TE04 598 aa17.36■□□□□ 0.37
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C9orf170-201ENST00000623052 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.35■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 NEUROD2Q15784 382 aa17.34■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 CGNL1Q0VF96 1302 aa17.34■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 RGS3P49796 1198 aa17.34■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 TNNQ9UQP3 1299 aa17.34■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 PTPRMP28827 1452 aa17.34■□□□□ 0.37
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa17.33■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 PDE3AQ14432 1141 aa17.33■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 CABP2Q9NPB3 220 aa17.33■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 NINLQ9Y2I6 1382 aa17.33■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 OSCARQ8IYS5 282 aa17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 IDI1Q13907 227 aa17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 COG6Q9Y2V7 657 aa17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PP64 1363 aa17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 EVC2Q86UK5 1308 aa17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 SLC4A3P48751 1232 aa17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.32■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 ZFYVE9O95405 1425 aa17.31■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 RLBP1P12271 317 aa17.31■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 NSD2O96028 1365 aa17.31■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 NLRP1Q9C000 1473 aa17.31■□□□□ 0.36
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C9orf170-201ENST00000623052 CLUAP1Q96AJ1 413 aa17.3■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.3■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 ABCC11Q96J66 1382 aa17.3■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.29■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 NEFMP07197 916 aa17.29■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC27Q2M243 656 aa17.28■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 USP19O94966 1318 aa17.28■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 WDR63Q8IWG1 891 aa17.28■□□□□ 0.36
C9orf170-201ENST00000623052 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.26■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa17.25■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.24■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 STK26Q9P289 416 aa17.24■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.24■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 CANXP27824 592 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SEC24BO95487 1268 aa17.23■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP53Q96M91 514 aa17.23■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 ALKQ9UM73 1620 aa17.23■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 USP35Q9P2H5 1018 aa17.23■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
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C9orf170-201ENST00000623052 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.22■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 MED14O60244 1454 aa17.21■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.21■□□□□ 0.35
C9orf170-201ENST00000623052 SLC52A1Q9NWF4 448 aa17.21■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PRAM1Q96QH2 718 aa17.19■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.19■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FYB1O15117 783 aa17.19■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 NFKBIBQ15653 356 aa17.19■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.18■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.18■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.18■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.18■□□□□ 0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.17■□□□□ 0.34
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