RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 TIE1P35590 1138 aa15.26■□□□□ 0.03
UBXN8-208ENST00000616306 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
UBXN8-208ENST00000616306 LHX8Q68G74 356 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN8-208ENST00000616306 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN8-208ENST00000616306 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN8-208ENST00000616306 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.25■□□□□ 0.03
UBXN8-208ENST00000616306 TOM1O60784 492 aa15.24■□□□□ 0.03
UBXN8-208ENST00000616306 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
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UBXN8-208ENST00000616306 TRIM52Q96A61 297 aa15.19■□□□□ 0.02
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UBXN8-208ENST00000616306 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.92□□□□□ -0.02
UBXN8-208ENST00000616306 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
UBXN8-208ENST00000616306 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.91□□□□□ -0.02
UBXN8-208ENST00000616306 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBXN8-208ENST00000616306 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
UBXN8-208ENST00000616306 PIK3C2GO75747 1445 aa14.9□□□□□ -0.02
UBXN8-208ENST00000616306 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBXN8-208ENST00000616306 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN8-208ENST00000616306 OTUD5Q96G74 571 aa14.89□□□□□ -0.03
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