RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, human

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGCR6-208	ENST00000608842	CPS1	P31327	1500 aa		31.79	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.78	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	POGK	Q9P215	609 aa		31.77	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.77	■■■□□ 2.68
DGCR6-208	ENST00000608842	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.76	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.75	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.75	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.74	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.73	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.73	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.72	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.71	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.71	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.71	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.7	■■■□□ 2.67
DGCR6-208	ENST00000608842	BCAN	Q96GW7	911 aa		31.68	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	DIP2A	Q14689	1571 aa		31.67	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.67	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.67	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.66	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		31.65	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.65	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.64	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
DGCR6-208	ENST00000608842	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.63	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		31.62	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.62	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.61	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.61	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	TBX22	Q9Y458	520 aa		31.6	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.58	■■■□□ 2.65
DGCR6-208	ENST00000608842	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
DGCR6-208	ENST00000608842		A0A1W2PP64	1363 aa		31.57	■■■□□ 2.64
DGCR6-208	ENST00000608842	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		31.54	■■■□□ 2.64
DGCR6-208	ENST00000608842	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
DGCR6-208	ENST00000608842	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.52	■■■□□ 2.64
DGCR6-208	ENST00000608842	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.49	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		31.49	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	ATP7B	P35670	1465 aa		31.48	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	NSD2	O96028	1365 aa		31.47	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	INSR	P06213	1382 aa		31.47	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.47	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.47	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.46	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.45	■■■□□ 2.63
DGCR6-208	ENST00000608842	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		31.45	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.45	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.44	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.44	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.42	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.4	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.4	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.4	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.4	■■■□□ 2.62
DGCR6-208	ENST00000608842	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.37	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.37	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.33	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	FYB1	O15117	783 aa		31.33	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.33	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		31.33	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.61
DGCR6-208	ENST00000608842	KCNA6	P17658	529 aa		31.31	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.28	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.28	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		31.28	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.27	■■■□□ 2.6
DGCR6-208	ENST00000608842	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
DGCR6-208	ENST00000608842	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.25	■■■□□ 2.59
DGCR6-208	ENST00000608842	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	31.25	■■■□□ 2.59
DGCR6-208	ENST00000608842	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
DGCR6-208	ENST00000608842	MTHFS	P49914	203 aa		31.22	■■■□□ 2.59
DGCR6-208	ENST00000608842	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.21	■■■□□ 2.59
DGCR6-208	ENST00000608842	NWD1	Q149M9	1564 aa		31.2	■■■□□ 2.59
DGCR6-208	ENST00000608842	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	31.19	■■■□□ 2.58
DGCR6-208	ENST00000608842	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
DGCR6-208	ENST00000608842	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
DGCR6-208	ENST00000608842	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.16	■■■□□ 2.58
DGCR6-208	ENST00000608842	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
DGCR6-208	ENST00000608842	ACE	P12821	1306 aa		31.14	■■■□□ 2.58
DGCR6-208	ENST00000608842	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.14	■■■□□ 2.57
DGCR6-208	ENST00000608842	NUDC	Q9Y266	331 aa		31.13	■■■□□ 2.57
DGCR6-208	ENST00000608842	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.12	■■■□□ 2.57
DGCR6-208	ENST00000608842	USP6	P35125	1406 aa		31.11	■■■□□ 2.57
DGCR6-208	ENST00000608842	NME9	Q86XW9	330 aa		31.11	■■■□□ 2.57
DGCR6-208	ENST00000608842	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
DGCR6-208	ENST00000608842	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms