RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 MED14O60244 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS3-204ENST00000575194 INSRP06213 1382 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SPNS3-204ENST00000575194 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 BCANQ96GW7 911 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 TBX22Q9Y458 520 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 STRCQ7RTU9 1775 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS3-204ENST00000575194 METP08581 1390 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS3-204ENST00000575194 DIP2AQ14689 1571 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS3-204ENST00000575194 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS3-204ENST00000575194 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SPNS3-204ENST00000575194 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS3-204ENST00000575194 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 USP32Q8NFA0 1604 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 NUDCQ9Y266 331 aa25.06■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 ABCC11Q96J66 1382 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 PIK3R4Q99570 1358 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 EVC2Q86UK5 1308 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 PPP2R1AP30153 589 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 STK26Q9P289 416 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 PTPRUQ92729 1446 aa25.04■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SPNS3-204ENST00000575194 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 TECPR2O15040 1411 aa25■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 DLC1Q96QB1 1528 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.99■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 SIRT1Q96EB6 747 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 PDE3BQ13370 1112 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.96■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 CPS1P31327 1500 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.95■■□□□ 1.59
SPNS3-204ENST00000575194 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 KCNA6P17658 529 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 PRAM1Q96QH2 718 aa24.94■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.92■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 PTCH1Q13635 1447 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 NSD2O96028 1365 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 NWD1Q149M9 1564 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 POGKQ9P215 609 aa24.89■■□□□ 1.58
SPNS3-204ENST00000575194 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.89■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.85■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 MORC1Q86VD1 984 aa24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SPNS3-204ENST00000575194 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 CABP2Q9NPB3 220 aa24.82■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.8■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.78■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.78■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SPNS3-204ENST00000575194 A0A1W2PP64 1363 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 SHPRHQ149N8 1683 aa24.76■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 NGEFQ8N5V2 710 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 ADGRB2O60241 1585 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 ATP7BP35670 1465 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 CFAP53Q96M91 514 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 CDK19Q9BWU1 502 aa24.72■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM94Q12767 1356 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.71■■□□□ 1.55
SPNS3-204ENST00000575194 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS3-204ENST00000575194 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS3-204ENST00000575194 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SPNS3-204ENST00000575194 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF521Q96K83 1311 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS3-204ENST00000575194 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS3-204ENST00000575194 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.66■■□□□ 1.54
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