RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.52	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRL1	O94910	1474 aa		11.52	□□□□□ -0.56
NUMB-231	ENST00000559312	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.52	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		11.52	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.52	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.52	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.52	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	ABCC1	P33527	1531 aa		11.51	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.51	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	KDM6B	O15054	1643 aa		11.51	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	FCHSD2	O94868	740 aa		11.5	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.5	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	PSEN2	P49810	448 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	PTGDR	Q13258	359 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.49	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	COL9A1	P20849	921 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.48	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.47	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	MBD5	Q9P267	1494 aa		11.46	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	GPR37	O15354	613 aa		11.46	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.46	□□□□□ -0.57
NUMB-231	ENST00000559312	KDM5C	P41229	1560 aa		11.46	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		11.46	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	HIC1	Q14526	733 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		11.45	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.44	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	GNPAT	O15228	680 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	PRSS12	P56730	875 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.43	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.42	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		11.41	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	ZMYND10	O75800	440 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	TSPY4	P0CV99	314 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	TSPY10	P0CW01	314 aa		11.4	□□□□□ -0.58
NUMB-231	ENST00000559312	DAPK1	P53355	1430 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	TK2	O00142	265 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.39	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ABCC5	O15440	1437 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		11.38	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.37	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.36	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	PLXNC1	O60486	1568 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ATP10A	O60312	1499 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	FECH	P22830	423 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.35	□□□□□ -0.59
NUMB-231	ENST00000559312	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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