RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558085.6

TPTEP1-205, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TPTEP1, Length 1,738 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-205ENST00000558085 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TPTEP1-205ENST00000558085 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TPTEP1-205ENST00000558085 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TPTEP1-205ENST00000558085 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.33■■■□□ 2.13
TPTEP1-205ENST00000558085 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.33■■■□□ 2.13
TPTEP1-205ENST00000558085 LTKP29376 864 aa28.32■■■□□ 2.12
TPTEP1-205ENST00000558085 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TPTEP1-205ENST00000558085 NUDCQ9Y266 331 aa28.29■■■□□ 2.12
TPTEP1-205ENST00000558085 DLC1Q96QB1 1528 aa28.28■■■□□ 2.12
TPTEP1-205ENST00000558085 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.27■■■□□ 2.12
TPTEP1-205ENST00000558085 PDE3BQ13370 1112 aa28.26■■■□□ 2.12
TPTEP1-205ENST00000558085 STK26Q9P289 416 aa28.26■■■□□ 2.12
TPTEP1-205ENST00000558085 BCANQ96GW7 911 aa28.26■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 MED14O60244 1454 aa28.25■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 ABCC11Q96J66 1382 aa28.24■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 METP08581 1390 aa28.24■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.22■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 PPP2R1AP30153 589 aa28.22■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 DIP2AQ14689 1571 aa28.21■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 EVC2Q86UK5 1308 aa28.21■■■□□ 2.11
TPTEP1-205ENST00000558085 TECPR2O15040 1411 aa28.19■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 PRAM1Q96QH2 718 aa28.18■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.17■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 SIRT1Q96EB6 747 aa28.17■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 POGKQ9P215 609 aa28.17■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 TBX22Q9Y458 520 aa28.17■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.16■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 USP32Q8NFA0 1604 aa28.15■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 CPS1P31327 1500 aa28.15■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.14■■■□□ 2.1
TPTEP1-205ENST00000558085 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.13■■■□□ 2.09
TPTEP1-205ENST00000558085 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.13■■■□□ 2.09
TPTEP1-205ENST00000558085 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.095e-6■■□□□ 12.2
TPTEP1-205ENST00000558085 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.11■■■□□ 2.09
TPTEP1-205ENST00000558085 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.1■■■□□ 2.09
TPTEP1-205ENST00000558085 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.093e-8■■■□□ 16.6
TPTEP1-205ENST00000558085 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.09■■■□□ 2.09
TPTEP1-205ENST00000558085 NSD2O96028 1365 aa28.07■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 PIK3R4Q99570 1358 aa28.07■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 PTPRUQ92729 1446 aa28.06■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.06■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.06■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.05■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.05■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.04■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 NGEFQ8N5V2 710 aa28.04■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.02■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.02■■■□□ 2.08
TPTEP1-205ENST00000558085 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.01■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 PTCH1Q13635 1447 aa28.01■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.01■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 CABP2Q9NPB3 220 aa27.98■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 CDK19Q9BWU1 502 aa27.97■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 MORC1Q86VD1 984 aa27.96■■■□□ 2.07
TPTEP1-205ENST00000558085 ADGRB2O60241 1585 aa27.95■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.94■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.92■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.89■■■□□ 2.06
TPTEP1-205ENST00000558085 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 KCNA6P17658 529 aa27.87■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 CFAP53Q96M91 514 aa27.87■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.86■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.86■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 ZNF521Q96K83 1311 aa27.85■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 A0A1W2PP64 1363 aa27.83■■■□□ 2.05
TPTEP1-205ENST00000558085 NWD1Q149M9 1564 aa27.82■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 GOLGA2Q08379 1002 aa27.81■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 ATP7BP35670 1465 aa27.8■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.8■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 HSPA2P54652 639 aa27.79■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.78■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.78■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 CABP1Q9NZU7 370 aa27.78■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.77■■■□□ 2.04
TPTEP1-205ENST00000558085 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.76■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.75■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 SHPRHQ149N8 1683 aa27.75■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.74■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.73■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 MTHFSP49914 203 aa27.72■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 RUNDC1Q96C34 613 aa27.72■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.72■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 SLFN5Q08AF3 891 aa27.71■■■□□ 2.03
TPTEP1-205ENST00000558085 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms