RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555707.5

PSMA3-AS1-209, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSMA3-AS1, Length 1,983 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.25■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.25■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 KCNA6P17658 529 aa15.23■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ALKQ9UM73 1620 aa15.23■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 TBX22Q9Y458 520 aa15.22■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PPLO60437 1756 aa15.21■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.21■□□□□ 0.03
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 RGL3Q3MIN7 710 aa15.2■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.2■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.2■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PTPRUQ92729 1446 aa15.2■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 APBB1O00213 710 aa15.2■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NWD1Q149M9 1564 aa15.19■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.19■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.18■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.18■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 METP08581 1390 aa15.17■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 TMEM94Q12767 1356 aa15.17■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 IFT172Q9UG01 1749 aa15.17■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.16■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.16■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 DIP2AQ14689 1571 aa15.16■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 MSH5O43196 834 aa15.15■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.15■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PIP4K2BP78356 416 aa15.15■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.15■□□□□ 0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PIK3R4Q99570 1358 aa15.12■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 TOM1O60784 492 aa15.11■□□□□ 0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 RAD21O60216 631 aa15.08■□□□□ 0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 HSPA1LP34931 641 aa15.07■□□□□ 0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.06■□□□□ 0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.05■□□□□ 0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 RGS22Q8NE09 1264 aa15.05■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PIK3C2GO75747 1445 aa15.05■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.04■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.04■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.04■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 IL27Q8NEV9 243 aa15.04■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 MSH6P52701 1360 aa15.03■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.03■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.02■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 MYOM2P54296 1465 aa15.02■□□□□ -0
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.02□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ZMYND10O75800 440 aa15.02□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 STK26Q9P289 416 aa15.02□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.01□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.01□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.01□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 SLAIN2Q9P270 581 aa15□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.99□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.99□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 MIER1Q8N108 512 aa14.98□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.98□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.98□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PTCH1Q13635 1447 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.97□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 WDR70Q9NW82 654 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 MTMR7Q9Y216 660 aa14.96□□□□□ -0.01
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ABCC11Q96J66 1382 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 STK25O00506 426 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ATF3P18847 181 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NEUROD1Q13562 356 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ADGRB1O14514 1584 aa14.95□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 TECPR2O15040 1411 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 MST1RQ04912 1400 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 LAMC1P11047 1609 aa14.94□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.93□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 BRINP3Q76B58 766 aa14.92□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PHLPP1O60346 1717 aa14.92□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 DCCP43146 1447 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 ZNF428Q96B54 188 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMA3-AS1-209ENST00000555707 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms