RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GOLIM4O00461 696 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 SETSIPP0DME0 302 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 AFAP1Q8N556 730 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.76□□□□□ -1.17
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PTPRB-210ENST00000551525 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 DEF6Q9H4E7 631 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP13Q86W25 1043 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 BANK1Q8NDB2 785 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 MNS1Q8NEH6 495 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 TDO2P48775 406 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ASXL2Q76L83 1435 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
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PTPRB-210ENST00000551525 RAPGEF3O95398 923 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 STK32BQ9NY57 414 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRKQ15262 1439 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 TEFQ10587 303 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 RAD21O60216 631 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC125Q86Z20 511 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 TNRQ92752 1358 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF11O15085 1522 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 CTR9Q6PD62 1173 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 KIF3AQ9Y496 699 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 TEX35Q5T0J7 233 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 WDR78Q5VTH9 848 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 LIG1P18858 919 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 GPATCH3Q96I76 525 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf37Q96NL8 207 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-210ENST00000551525 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 KIF20AO95235 890 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS2O95450 1211 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 ABCC2Q92887 1545 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS12P58397 1594 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 CCP110O43303 1012 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP74Q9C0B2 1584 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K9P80192 1104 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 GPS2Q13227 327 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 YY1P25490 414 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 CEP120Q8N960 986 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 GORABQ5T7V8 394 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 HMMRO75330 724 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 VGLL3A8MV65 326 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 H0YHG0 523 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-210ENST00000551525 CCER2I3L3R5 266 aa7.69□□□□□ -1.18
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