RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 PIK3R4Q99570 1358 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 ATRNO75882 1429 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 KIF1BO60333 1816 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-218ENST00000550159 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 DCCP43146 1447 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 MST1RQ04912 1400 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 LRP5O75197 1615 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 YY1P25490 414 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 PTCH1Q13635 1447 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 PTPRUQ92729 1446 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-218ENST00000550159 CLTCL1P53675 1640 aa13.71□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.7□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 BCL9LQ86UU0 1499 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 ORAI2Q96SN7 254 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 BAG6P46379 1132 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 IFFO2Q5TF58 517 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 SEPT12Q8IYM1 358 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 C1orf167Q5SNV9 1468 aa13.65□□□□□ -0.22
CS-218ENST00000550159 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.64□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 METP08581 1390 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 MYOM2P54296 1465 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-218ENST00000550159 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 GLI3P10071 1580 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 SLC24A1O60721 1099 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 PPLO60437 1756 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 A0A0G2JS52 829 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 MYT1Q01538 1121 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 LAMC1P11047 1609 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 FOXO3O43524 673 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 VPS72Q15906 364 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 SLIT2O94813 1529 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 PIK3C2GO75747 1445 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 BRWD3Q6RI45 1802 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-218ENST00000550159 POGKQ9P215 609 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 IFT172Q9UG01 1749 aa13.52□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 STK26Q9P289 416 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 PXDNQ92626 1479 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 PLEKHG5O94827 1062 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 FAM182BQ5T319 152 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-218ENST00000550159 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 NUTM2FA1L443 756 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 CDCA8Q53HL2 280 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 C1QTNF8P60827 252 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 SIRT1Q96EB6 747 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 SPON1Q9HCB6 807 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 ABCC11Q96J66 1382 aa13.43□□□□□ -0.26
CS-218ENST00000550159 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms