RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526929.1

USP17L4-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L4, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4-201ENST00000526929 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP17L4-201ENST00000526929 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP17L4-201ENST00000526929 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.96■□□□□ 0.15
USP17L4-201ENST00000526929 NLRP13Q86W25 1043 aa15.96■□□□□ 0.15
USP17L4-201ENST00000526929 SIRT1Q96EB6 747 aa15.96■□□□□ 0.15
USP17L4-201ENST00000526929 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.96■□□□□ 0.15
USP17L4-201ENST00000526929 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.96■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.96■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 DIP2AQ14689 1571 aa15.95■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 USP32Q8NFA0 1604 aa15.95■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 TMC1Q8TDI8 760 aa15.95■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.94■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.93■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 BCANQ96GW7 911 aa15.92■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.92■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.92■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 CABP2Q9NPB3 220 aa15.91■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.91■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 TBX22Q9Y458 520 aa15.9■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.9■□□□□ 0.14
USP17L4-201ENST00000526929 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.89■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.89■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 CDK19Q9BWU1 502 aa15.87■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 ADGRB2O60241 1585 aa15.87■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.86■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 PPP2R1AP30153 589 aa15.86■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 PTPRUQ92729 1446 aa15.86■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 NSD2O96028 1365 aa15.85■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.85■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 PTCH1Q13635 1447 aa15.85■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 INSRP06213 1382 aa15.85■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 PIK3R4Q99570 1358 aa15.85■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.84■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.84■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.84■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 A0A1W2PP64 1363 aa15.84■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.84■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
USP17L4-201ENST00000526929 ATP7BP35670 1465 aa15.83■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.83■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.83■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.8■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.8■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 CABP1Q9NZU7 370 aa15.79■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 MORC1Q86VD1 984 aa15.78■□□□□ 0.12
USP17L4-201ENST00000526929 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.77■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.77■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.77■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.77■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.76■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 AKAP12Q02952 1782 aa15.75■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 ITSN1Q15811 1721 aa15.75■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.75■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.73■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 FYB1O15117 783 aa15.72■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 KCNA6P17658 529 aa15.71■□□□□ 0.11
USP17L4-201ENST00000526929 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.7■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 SHPRHQ149N8 1683 aa15.69■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.69■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.68■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 NWD1Q149M9 1564 aa15.68■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.68■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.68■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.67■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.67■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.67■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 MTHFSP49914 203 aa15.66■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 CFAP53Q96M91 514 aa15.66■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
USP17L4-201ENST00000526929 PDE3BQ13370 1112 aa15.64■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 ACEP12821 1306 aa15.63■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 USP6P35125 1406 aa15.63■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.63■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 NUDCQ9Y266 331 aa15.62■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 SSH2Q76I76 1423 aa15.6■□□□□ 0.09
USP17L4-201ENST00000526929 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms