RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC26A8Q96RN1 970 aa3.65□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ADGRB2O60241 1585 aa3.64□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MLH3Q9UHC1 1453 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa3.64□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa3.64□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MCOLN1Q9GZU1 580 aa3.63□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM196AQ6ZSG2 479 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-548P-201ENST00000517083 WBP1LQ9NX94 342 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCA6Q8N139 1617 aa3.62□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.61□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.59□□□□□ -1.84
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLGA3Q08378 1498 aa3.57□□□□□ -1.84
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TULP4Q9NRJ4 1543 aa3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-548P-201ENST00000517083 RREB1Q92766 1687 aa3.53□□□□□ -1.84
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM265A0A087WTH1 108 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLSCR1O15162 318 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-548P-201ENST00000517083 DSG3P32926 999 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-548P-201ENST00000517083 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC24Q8N4L8 307 aa3.53□□□□□ -1.84
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf71Q711Q0 1435 aa3.53□□□□□ -1.85
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERBB4Q15303 1308 aa3.52□□□□□ -1.85
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PROM2Q8N271 834 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-548P-201ENST00000517083 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-548P-201ENST00000517083 STAG3Q9UJ98 1225 aa3.52□□□□□ -1.85
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