RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.37■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 CABP2Q9NPB3 220 aa35.37■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 TMC1Q8TDI8 760 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 MED14O60244 1454 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 NLRP13Q86W25 1043 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 TECPR2O15040 1411 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXB3-212ENST00000498678 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.32■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 SIRT1Q96EB6 747 aa35.32■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 CPS1P31327 1500 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 CDK19Q9BWU1 502 aa35.26■■■■□ 3.24
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
HOXB3-212ENST00000498678 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXB3-212ENST00000498678 TBX22Q9Y458 520 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-212ENST00000498678 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-212ENST00000498678 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXB3-212ENST00000498678 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXB3-212ENST00000498678 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.2■■■■□ 3.22
HOXB3-212ENST00000498678 PTPRUQ92729 1446 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXB3-212ENST00000498678 PPP2R1AP30153 589 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXB3-212ENST00000498678 DIP2AQ14689 1571 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXB3-212ENST00000498678 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
HOXB3-212ENST00000498678 USP32Q8NFA0 1604 aa35.14■■■■□ 3.22
HOXB3-212ENST00000498678 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 A0A1W2PP64 1363 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 CABP1Q9NZU7 370 aa35.07■■■■□ 3.21
HOXB3-212ENST00000498678 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.04■■■■□ 3.2
HOXB3-212ENST00000498678 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
HOXB3-212ENST00000498678 PTCH1Q13635 1447 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXB3-212ENST00000498678 PIK3R4Q99570 1358 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-212ENST00000498678 ADGRB2O60241 1585 aa35.01■■■■□ 3.2
HOXB3-212ENST00000498678 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
HOXB3-212ENST00000498678 MORC1Q86VD1 984 aa35.01■■■■□ 3.19
HOXB3-212ENST00000498678 NSD2O96028 1365 aa35.01■■■■□ 3.19
HOXB3-212ENST00000498678 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
HOXB3-212ENST00000498678 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
HOXB3-212ENST00000498678 ATP7BP35670 1465 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXB3-212ENST00000498678 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.95■■■■□ 3.19
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 INSRP06213 1382 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 KCNA6P17658 529 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 FYB1O15117 783 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMTS8Q9UP79 889 aa34.87■■■■□ 3.17
HOXB3-212ENST00000498678 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.86■■■■□ 3.17
HOXB3-212ENST00000498678 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
HOXB3-212ENST00000498678 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
HOXB3-212ENST00000498678 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.85■■■■□ 3.17
HOXB3-212ENST00000498678 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
HOXB3-212ENST00000498678 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.174e-9■■□□□ 12.8
HOXB3-212ENST00000498678 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.79■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 NUTM2FA1L443 756 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 MTHFSP49914 203 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.78■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
HOXB3-212ENST00000498678 AKAP12Q02952 1782 aa34.76■■■■□ 3.15
HOXB3-212ENST00000498678 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-212ENST00000498678 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB3-212ENST00000498678 ITSN1Q15811 1721 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXB3-212ENST00000498678 ACEP12821 1306 aa34.71■■■■□ 3.15
HOXB3-212ENST00000498678 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
HOXB3-212ENST00000498678 CFAP53Q96M91 514 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXB3-212ENST00000498678 NME9Q86XW9 330 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-212ENST00000498678 SHPRHQ149N8 1683 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXB3-212ENST00000498678 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
HOXB3-212ENST00000498678 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
HOXB3-212ENST00000498678 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXB3-212ENST00000498678 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXB3-212ENST00000498678 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.63■■■■□ 3.13
HOXB3-212ENST00000498678 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
HOXB3-212ENST00000498678 NWD1Q149M9 1564 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-212ENST00000498678 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-212ENST00000498678 USP6P35125 1406 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXB3-212ENST00000498678 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.61■■■■□ 3.13
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