RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487692.1

AKAP9-212, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 2

Gene AKAP9, Length 869 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-212ENST00000487692 PTPREP23469 700 aa11.95□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 PDE4CQ08493 712 aa11.95□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 GPR37L1O60883 481 aa11.94□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 HOXA2O43364 376 aa11.93□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 USP46P62068 366 aa11.93□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 PACS2Q86VP3 889 aa11.93□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 FDX1P10109 184 aa11.92□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 GCGRP47871 477 aa11.92□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.92□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.92□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.92□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 SMAPO00193 183 aa11.91□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 RFX1P22670 979 aa11.91□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.91□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 WASHC4Q2M389 1173 aa11.91□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 MTMR7Q9Y216 660 aa11.9□□□□□ -0.5
AKAP9-212ENST00000487692 GUCA2AQ02747 115 aa11.88□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 VAC14Q08AM6 782 aa11.87□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 HLA-CQ95604 372 aa11.87□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.87□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 HCSTQ9UBK5 93 aa11.87□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 USTQ9Y2C2 406 aa11.87□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 PROX2Q3B8N5 592 aa11.86□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 SLC10A3P09131 477 aa11.85□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.85□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 KCNK17Q96T54 332 aa11.85□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 ALG2Q9H553 416 aa11.85□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 BRD1O95696 1058 aa11.84□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.84□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 KCNA1Q09470 495 aa11.84□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.84□□□□□ -0.51
AKAP9-212ENST00000487692 MTMR2Q13614 643 aa11.83□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 KCNH8Q96L42 1107 aa11.83□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 CARNS1A5YM72 827 aa11.81□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 CFAP99D6REC4 459 aa11.81□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.81□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 TSC1Q92574 1164 aa11.8□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 UCN2Q96RP3 112 aa11.8□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 PBX2P40425 430 aa11.79□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.79□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.79□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 PRR7Q8TB68 274 aa11.78□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
AKAP9-212ENST00000487692 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.77□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 C6orf229H3BNL8 230 aa11.75□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 SOX11P35716 441 aa11.75□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 PSEN2P49810 448 aa11.75□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 ZNF428Q96B54 188 aa11.74□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 ATG7O95352 703 aa11.73□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 FUT2Q10981 343 aa11.73□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 CDCA8Q53HL2 280 aa11.73□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 ARHGAP33O14559 1287 aa11.72□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 NR6A1Q15406 480 aa11.72□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 SLF2Q8IX21 1173 aa11.72□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.71□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.71□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.71□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.71□□□□□ -0.53
AKAP9-212ENST00000487692 SEMA3FQ13275 785 aa11.7□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.7□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.7□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.7□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.69□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 CFHP08603 1231 aa11.67□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.67□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 ATP6V1AP38606 617 aa11.66□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.65□□□□□ -0.54
AKAP9-212ENST00000487692 ATP9BO43861 1147 aa11.64□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 SLC4A3P48751 1232 aa11.64□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 CCDC27Q2M243 656 aa11.63□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 PNMA1Q8ND90 353 aa11.63□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.62□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 RETREG3Q86VR2 466 aa11.62□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.62□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 RGS20O76081 388 aa11.61□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 NR1H3Q13133 447 aa11.61□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 DESI1Q6ICB0 168 aa11.6□□□□□ -0.55
AKAP9-212ENST00000487692 NBPF3Q9H094 633 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms