RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 STK26Q9P289 416 aa23.74■■□□□ 1.39
HCLS1-208ENST00000487290 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
HCLS1-208ENST00000487290 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.73■■□□□ 1.39
HCLS1-208ENST00000487290 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.73■■□□□ 1.39
HCLS1-208ENST00000487290 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.71■■□□□ 1.39
HCLS1-208ENST00000487290 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.71■■□□□ 1.39
HCLS1-208ENST00000487290 PRAM1Q96QH2 718 aa23.7■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.7■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.7■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 C14orf37Q86TY3 774 aa23.67■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 ATF3P18847 181 aa23.66■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.66■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.65■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 SLAIN2Q9P270 581 aa23.65■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.64■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 USP32Q8NFA0 1604 aa23.64■■□□□ 1.38
HCLS1-208ENST00000487290 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.63■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.63■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 POGKQ9P215 609 aa23.62■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 KIF1AQ12756 1690 aa23.6■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.6■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.59■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 ITSN1Q15811 1721 aa23.58■■□□□ 1.37
HCLS1-208ENST00000487290 ATP7BP35670 1465 aa23.56■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 PIP4K2BP78356 416 aa23.55■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 BRINP3Q76B58 766 aa23.55■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 PHLPP1O60346 1717 aa23.54■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HCLS1-208ENST00000487290 USP47Q96K76 1375 aa23.51■■□□□ 1.35
HCLS1-208ENST00000487290 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HCLS1-208ENST00000487290 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.48■■□□□ 1.35
HCLS1-208ENST00000487290 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HCLS1-208ENST00000487290 PXDNQ92626 1479 aa23.47■■□□□ 1.35
HCLS1-208ENST00000487290 HSPA1LP34931 641 aa23.46■■□□□ 1.35
HCLS1-208ENST00000487290 TESK2Q96S53 571 aa23.46■■□□□ 1.35
HCLS1-208ENST00000487290 SHPRHQ149N8 1683 aa23.45■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 ORAI2Q96SN7 254 aa23.45■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 EVC2Q86UK5 1308 aa23.43■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 SLC24A1O60721 1099 aa23.43■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 CDK19Q9BWU1 502 aa23.43■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.41■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.4■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.4■■□□□ 1.34
HCLS1-208ENST00000487290 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.39■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.39■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 NUTM2FA1L443 756 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 AKAP12Q02952 1782 aa23.36■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 ALS2Q96Q42 1657 aa23.35■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.35■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 JCADQ9P266 1359 aa23.35■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 SBNO1A3KN83 1393 aa23.34■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 CABP2Q9NPB3 220 aa23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-208ENST00000487290 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 FOXO3O43524 673 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 MYOM1P52179 1685 aa23.29■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.29■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.28■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 SSH2Q76I76 1423 aa23.27■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 TMF1P82094 1093 aa23.27■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.27■■□□□ 1.32
HCLS1-208ENST00000487290 ABCA3Q99758 1704 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 ACEP12821 1306 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 USP6P35125 1406 aa23.25■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.24■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 USP54Q70EL1 1684 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 PSME1Q06323 249 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 CDCA8Q53HL2 280 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGEF10O15013 1369 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-208ENST00000487290 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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