RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.14■□□□□ 0.33
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SH3BP1-206ENST00000469947 ERBB4Q15303 1308 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP1-206ENST00000469947 AAMPQ13685 434 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BP1-206ENST00000469947 MORC1Q86VD1 984 aa17.12■□□□□ 0.33
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SH3BP1-206ENST00000469947 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC27Q2M243 656 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 SMC5Q8IY18 1101 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.94■□□□□ 0.3
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SH3BP1-206ENST00000469947 SSFA2P28290 1259 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.93■□□□□ 0.3
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