RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469145.5

HDGF-205, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 2

Gene HDGF, Length 844 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-205	ENST00000469145	TESK2	Q96S53	571 aa		27.97	■■■□□ 2.07
HDGF-205	ENST00000469145	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		27.95	■■■□□ 2.07
HDGF-205	ENST00000469145	NWD1	Q149M9	1564 aa		27.94	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	SIRT1	Q96EB6	747 aa		27.93	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	MET	P08581	1390 aa		27.92	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	POGK	Q9P215	609 aa		27.92	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		27.91	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	STK26	Q9P289	416 aa		27.91	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	PTCH1	Q13635	1447 aa		27.89	■■■□□ 2.06
HDGF-205	ENST00000469145	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	EVC2	Q86UK5	1308 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	KCNA6	P17658	529 aa		27.85	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		27.85	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	PRAM1	Q96QH2	718 aa		27.84	■■■□□ 2.05
HDGF-205	ENST00000469145	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
HDGF-205	ENST00000469145	ADGRB2	O60241	1585 aa		27.81	■■■□□ 2.04
HDGF-205	ENST00000469145	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		27.8	■■■□□ 2.04
HDGF-205	ENST00000469145	MYOM1	P52179	1685 aa		27.79	■■■□□ 2.04
HDGF-205	ENST00000469145	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		27.79	■■■□□ 2.04
HDGF-205	ENST00000469145	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		27.78	■■■□□ 2.04
HDGF-205	ENST00000469145	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
HDGF-205	ENST00000469145	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		27.76	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		27.76	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	PTPRU	Q92729	1446 aa		27.75	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	ANP32C	O43423	234 aa		27.73	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		27.73	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
HDGF-205	ENST00000469145	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
HDGF-205	ENST00000469145	MSH6	P52701	1360 aa		27.68	■■■□□ 2.02
HDGF-205	ENST00000469145	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HDGF-205	ENST00000469145	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HDGF-205	ENST00000469145	ITSN1	Q15811	1721 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HDGF-205	ENST00000469145	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
HDGF-205	ENST00000469145	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
HDGF-205	ENST00000469145	PHLPP1	O60346	1717 aa		27.64	■■■□□ 2.01
HDGF-205	ENST00000469145	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		27.62	■■■□□ 2.01
HDGF-205	ENST00000469145	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
HDGF-205	ENST00000469145	CDK19	Q9BWU1	502 aa		27.61	■■■□□ 2.01
HDGF-205	ENST00000469145	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		27.59	■■■□□ 2.01
HDGF-205	ENST00000469145	USP32	Q8NFA0	1604 aa		27.59	■■■□□ 2.01
HDGF-205	ENST00000469145	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
HDGF-205	ENST00000469145	ATP7B	P35670	1465 aa		27.57	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	TMC1	Q8TDI8	760 aa		27.57	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	PANK3	Q9H999	370 aa		27.57	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		27.57	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		27.57	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.57	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		27.57	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		27.56	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		27.56	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	CABP2	Q9NPB3	220 aa		27.56	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		27.56	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	SLAIN2	Q9P270	581 aa		27.56	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		27.55	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	MIER1	Q8N108	512 aa		27.54	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		27.52	■■■□□ 2
HDGF-205	ENST00000469145	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.5	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.5	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		27.5	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	RALBP1	Q15311	655 aa		27.49	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		27.49	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	AKAP12	Q02952	1782 aa		27.48	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	DCC	P43146	1447 aa		27.47	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	NSD2	O96028	1365 aa		27.47	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		27.46	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		27.46	■■□□□ 1.99
HDGF-205	ENST00000469145	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		27.45	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	JCAD	Q9P266	1359 aa		27.45	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.44	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		27.44	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		27.43	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		27.42	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		27.42	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145		A0A1W2PP64	1363 aa		27.42	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	POTEA	Q6S8J7	498 aa		27.41	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	SHPRH	Q149N8	1683 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	ATF3	P18847	181 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	LRP6	O75581	1613 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	CABP1	Q9NZU7	370 aa		27.39	■■□□□ 1.98
HDGF-205	ENST00000469145	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		27.38	■■□□□ 1.97
HDGF-205	ENST00000469145	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
HDGF-205	ENST00000469145	KIF1A	Q12756	1690 aa		27.37	■■□□□ 1.97

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