RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.35■■□□□ 1.33
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.34■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC11Q96J66 1382 aa23.34■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CABP2Q9NPB3 220 aa23.31■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FKBP8Q14318 412 aa23.3■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.29■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NSD2O96028 1365 aa23.28■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.27■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCANQ96GW7 911 aa23.27■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TECPR2O15040 1411 aa23.27■■□□□ 1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLIT1O75093 1534 aa23.26■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CPS1P31327 1500 aa23.26■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 METP08581 1390 aa23.26■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIRT1Q96EB6 747 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EID1Q9Y6B2 187 aa23.25■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUDCQ9Y266 331 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MORC1Q86VD1 984 aa23.24■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.23■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDK19Q9BWU1 502 aa23.22■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A1W2PP64 1363 aa23.21■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.21■■□□□ 1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PDE3BQ13370 1112 aa23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.19■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.18■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.18■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LTKP29376 864 aa23.17■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DIP2AQ14689 1571 aa23.17■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP7BP35670 1465 aa23.17■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MED14O60244 1454 aa23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.15■■□□□ 1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.13■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.13■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.12■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRB2O60241 1585 aa23.12■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CABP1Q9NZU7 370 aa23.11■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP53Q96M91 514 aa23.1■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TBX22Q9Y458 520 aa23.09■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.09■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHPRHQ149N8 1683 aa23.08■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.07■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.05■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.05■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ITSN1Q15811 1721 aa23.05■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTCH1Q13635 1447 aa23.05■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTHFSP49914 203 aa23.04■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NGEFQ8N5V2 710 aa23.04■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPRUQ92729 1446 aa23.04■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FYB1O15117 783 aa23.03■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.03■■□□□ 1.28
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AKAP12Q02952 1782 aa23.02■■□□□ 1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIK3R4Q99570 1358 aa23■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.99■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.98■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF521Q96K83 1311 aa22.96■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.96■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.95■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.95■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APAF1O14727 1248 aa22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GOLGA2Q08379 1002 aa22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.94■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.267e-8■■■□□ 15.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RUNDC1Q96C34 613 aa22.93■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.9■■□□□ 1.26
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