RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SLIT1O75093 1534 aa10.96□□□□□ -0.65
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RABGEF1-203ENST00000439720 POGKQ9P215 609 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF15Q9NS87 1388 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 STRCQ7RTU9 1775 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVK-7P63135 1459 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 NECTIN2Q92692 538 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 MED14O60244 1454 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 IFT172Q9UG01 1749 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.94□□□□□ -0.664e-6■■■□□ 18.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 DIP2AQ14689 1571 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRB3O60242 1522 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNMO15061 1565 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 KANK1Q14678 1352 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPM2O94759 1503 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 IQGAP1P46940 1657 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 ZMYM3Q14202 1370 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-203ENST00000439720 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 TMC1Q8TDI8 760 aa10.9□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 PLIN1O60240 522 aa10.89□□□□□ -0.67
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RABGEF1-203ENST00000439720 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCN1P35523 988 aa10.88□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 NWD1Q149M9 1564 aa10.88□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 CRBNQ96SW2 442 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.87□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 TNRQ92752 1358 aa10.86□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF1BO60333 1816 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM161AQ3B820 660 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf34Q49A92 452 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 PANK2Q9BZ23 570 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 CPS1P31327 1500 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF592Q92610 1267 aa10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
RABGEF1-203ENST00000439720 INSRP06213 1382 aa10.84□□□□□ -0.67
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RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD1Q16676 465 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.83□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.82□□□□□ -0.68
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RABGEF1-203ENST00000439720 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS3P49796 1198 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 MYOM2P54296 1465 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 CLTCL1P53675 1640 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFYVE9O95405 1425 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
RABGEF1-203ENST00000439720 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
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RABGEF1-203ENST00000439720 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.79□□□□□ -0.68
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.78□□□□□ -0.68
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RABGEF1-203ENST00000439720 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-203ENST00000439720 MYOM1P52179 1685 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP155O75694 1391 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3R4Q99570 1358 aa10.76□□□□□ -0.69
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RABGEF1-203ENST00000439720 ESPNB1AK53 854 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-203ENST00000439720 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGEF1-203ENST00000439720 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
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