RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 MYOM1P52179 1685 aa18.73■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.72■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 USP35Q9P2H5 1018 aa18.72■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.72■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.71■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.71■□□□□ 0.59
TTLL1-203ENST00000439248 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.7■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 ADAMTS8Q9UP79 889 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 NLRP1Q9C000 1473 aa18.69■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 GOLGA2Q08379 1002 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.67■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 CRBNQ96SW2 442 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.66■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL1-203ENST00000439248 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 SLFN5Q08AF3 891 aa18.63■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.62■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 ZFYVE9O95405 1425 aa18.59■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 E9PSI1 815 aa18.58■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 AAMPQ13685 434 aa18.58■□□□□ 0.57
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.58■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 USP32Q8NFA0 1604 aa18.57■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.57■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.57■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 PLIN1O60240 522 aa18.56■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 FBXO41Q8TF61 875 aa18.56■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 SLIT1O75093 1534 aa18.54■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.54■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 NBR1Q14596 966 aa18.54■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.53■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 PDE3AQ14432 1141 aa18.53■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 FAM161AQ3B820 660 aa18.53■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
TTLL1-203ENST00000439248 LTKP29376 864 aa18.51■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 ALKQ9UM73 1620 aa18.51■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 STRCQ7RTU9 1775 aa18.51■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.5■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.5■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 ADGRB1O14514 1584 aa18.49■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.49■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.48■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 CERKQ8TCT0 537 aa18.48■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 EID1Q9Y6B2 187 aa18.47■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 NSD2O96028 1365 aa18.46■□□□□ 0.55
TTLL1-203ENST00000439248 APAF1O14727 1248 aa18.45■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.45■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.44■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 SHPRHQ149N8 1683 aa18.44■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC27Q2M243 656 aa18.44■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 MED14O60244 1454 aa18.43■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.43■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 C8orf34Q49A92 452 aa18.43■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.43■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.42■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 WDR63Q8IWG1 891 aa18.42■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.42■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.42■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 NEFMP07197 916 aa18.41■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.41■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.41■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 RUNDC1Q96C34 613 aa18.4■□□□□ 0.54
TTLL1-203ENST00000439248 WWC1Q8IX03 1113 aa18.39■□□□□ 0.53
TTLL1-203ENST00000439248 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.39■□□□□ 0.53
TTLL1-203ENST00000439248 STK26Q9P289 416 aa18.39■□□□□ 0.53
TTLL1-203ENST00000439248 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TTLL1-203ENST00000439248 METP08581 1390 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms