RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429159.6

MEG3-208, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,608 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-208ENST00000429159 METP08581 1390 aa25.3■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.3■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 TECPR2O15040 1411 aa25.29■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 DIP2AQ14689 1571 aa25.29■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 TMC1Q8TDI8 760 aa25.29■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.28■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.28■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 NLRP13Q86W25 1043 aa25.27■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 TBX22Q9Y458 520 aa25.27■■□□□ 1.64
MEG3-208ENST00000429159 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 CPS1P31327 1500 aa25.25■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.24■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 MED14O60244 1454 aa25.24■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 CABP2Q9NPB3 220 aa25.22■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.2■■□□□ 1.63
MEG3-208ENST00000429159 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.2■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 CCDC184Q52MB2 194 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 CDK19Q9BWU1 502 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 PIK3R4Q99570 1358 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.18■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.15■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.15■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.14■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 USP32Q8NFA0 1604 aa25.14■■□□□ 1.62
MEG3-208ENST00000429159 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
MEG3-208ENST00000429159 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.617e-8■■□□□ 13.8
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MEG3-208ENST00000429159 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.14■■□□□ 1.61
MEG3-208ENST00000429159 NSD2O96028 1365 aa25.13■■□□□ 1.61
MEG3-208ENST00000429159 PTCH1Q13635 1447 aa25.13■■□□□ 1.61
MEG3-208ENST00000429159 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.12■■□□□ 1.61
MEG3-208ENST00000429159 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
MEG3-208ENST00000429159 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.1■■□□□ 1.61
MEG3-208ENST00000429159 ADGRB2O60241 1585 aa25.08■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 PPP2R1AP30153 589 aa25.08■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 ATP7BP35670 1465 aa25.07■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 PTPRUQ92729 1446 aa25.06■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 MORC1Q86VD1 984 aa25.05■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 A0A1W2PP64 1363 aa25.05■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 CABP1Q9NZU7 370 aa25.04■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.04■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 INSRP06213 1382 aa25.04■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
MEG3-208ENST00000429159 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.01■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.97■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
MEG3-208ENST00000429159 KCNA6P17658 529 aa24.94■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.93■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 CFAP53Q96M91 514 aa24.92■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.9■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 ITSN1Q15811 1721 aa24.9■■□□□ 1.58
MEG3-208ENST00000429159 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.89■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.89■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.88■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.88■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 FYB1O15117 783 aa24.88■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.87■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.86■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.85■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 AKAP12Q02952 1782 aa24.85■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.85■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.84■■□□□ 1.57
MEG3-208ENST00000429159 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.82■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 NWD1Q149M9 1564 aa24.82■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 MTHFSP49914 203 aa24.81■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 ACEP12821 1306 aa24.79■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.78■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.78■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 PDE3BQ13370 1112 aa24.78■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 COG3Q96JB2 828 aa24.78■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 NUTM2FA1L443 756 aa24.77■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 C14orf37Q86TY3 774 aa24.77■■□□□ 1.56
MEG3-208ENST00000429159 NGEFQ8N5V2 710 aa24.76■■□□□ 1.55
MEG3-208ENST00000429159 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
MEG3-208ENST00000429159 NUDCQ9Y266 331 aa24.76■■□□□ 1.55
MEG3-208ENST00000429159 USP6P35125 1406 aa24.75■■□□□ 1.55
MEG3-208ENST00000429159 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.75■■□□□ 1.55
MEG3-208ENST00000429159 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.74■■□□□ 1.55
MEG3-208ENST00000429159 NEFLP07196 543 aa24.74■■□□□ 1.55
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