RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 STAC3Q96MF2 364 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 E9PSI1 815 aa23.64■■□□□ 1.38
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRB3O60242 1522 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHDP01880 384 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 NOS1P29475 1434 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 IFT172Q9UG01 1749 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 MYOM2P54296 1465 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVK-7P63135 1459 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 USP19O94966 1318 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PANK1Q8TE04 598 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 COG6Q9Y2V7 657 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 WWC1Q8IX03 1113 aa23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 IDI1Q13907 227 aa23.54■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE3AQ14432 1141 aa23.54■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.54■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.53■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PPLO60437 1756 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3C2BO00750 1634 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC24BO95487 1268 aa23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NEUROD2Q15784 382 aa23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NGEFQ8N5V2 710 aa23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 POGKQ9P215 609 aa23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 BECN1Q14457 450 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC24A1O60721 1099 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MLECQ14165 292 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP1Q9C000 1473 aa23.45■■□□□ 1.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SHPRHQ149N8 1683 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 MORC1Q86VD1 984 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 TNNQ9UQP3 1299 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 RLBP1P12271 317 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRB1O14514 1584 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 REREQ9P2R6 1566 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 AGLP35573 1532 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 RUNDC1Q96C34 613 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-208ENST00000424082 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 MTHFSP49914 203 aa23.34■■□□□ 1.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.33■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.33■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR63Q8IWG1 891 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYM3Q14202 1370 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 AAMPQ13685 434 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFYVE9O95405 1425 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms