RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.15■■□□□ 1.78
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PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF20Q5VTR2 975 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
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PTPRJ-201ENST00000418331 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ERC2O15083 957 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-201ENST00000418331 APPP05067 770 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK19Q9BWU1 502 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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PTPRJ-201ENST00000418331 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.1■■□□□ 1.77
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PTPRJ-201ENST00000418331 ERBINQ96RT1 1412 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-201ENST00000418331 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.08■■□□□ 1.77
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PTPRJ-201ENST00000418331 PDE3AQ14432 1141 aa26.06■■□□□ 1.76
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PTPRJ-201ENST00000418331 VPS53Q5VIR6 699 aa26.05■■□□□ 1.76
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PTPRJ-201ENST00000418331 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.05■■□□□ 1.76
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PTPRJ-201ENST00000418331 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.03■■□□□ 1.76
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PTPRJ-201ENST00000418331 WDR97A6NE52 1622 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRJ-201ENST00000418331 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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PTPRJ-201ENST00000418331 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.98■■□□□ 1.75
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PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGEF11O15085 1522 aa25.97■■□□□ 1.75
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PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.95■■□□□ 1.74
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PTPRJ-201ENST00000418331 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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PTPRJ-201ENST00000418331 FSD1Q9BTV5 496 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD21O60216 631 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-201ENST00000418331 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-201ENST00000418331 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
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