RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
KCNQ1-204ENST00000380776 MYOM1P52179 1685 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.27□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 CPS1P31327 1500 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 NSD2O96028 1365 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 INSRP06213 1382 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 LTKP29376 864 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 MED14O60244 1454 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.26□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.25□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.25□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 METP08581 1390 aa9.24□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 USP32Q8NFA0 1604 aa9.24□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 PTCH1Q13635 1447 aa9.23□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.23□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 CDK19Q9BWU1 502 aa9.23□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.22□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 CABP2Q9NPB3 220 aa9.22□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.22□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP7BP35670 1465 aa9.21□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 ADGRB2O60241 1585 aa9.21□□□□□ -0.93
KCNQ1-204ENST00000380776 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.21□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 PPP2R1AP30153 589 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 MORC1Q86VD1 984 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.2□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC184Q52MB2 194 aa9.19□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.19□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.19□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.19□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 A0A1W2PP64 1363 aa9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 CFAP53Q96M91 514 aa9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.18□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 PTPRUQ92729 1446 aa9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 NGEFQ8N5V2 710 aa9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 CABP1Q9NZU7 370 aa9.17□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.16□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 PDE3BQ13370 1112 aa9.15□□□□□ -0.94
KCNQ1-204ENST00000380776 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.15□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 KCNA6P17658 529 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 ITSN1Q15811 1721 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.14□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 NUDCQ9Y266 331 aa9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 FYB1O15117 783 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 NEFLP07196 543 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.12□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 NWD1Q149M9 1564 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.11□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 AKAP12Q02952 1782 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 COG3Q96JB2 828 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.1□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 MTHFSP49914 203 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.09□□□□□ -0.95
KCNQ1-204ENST00000380776 ACEP12821 1306 aa9.08□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.08□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 USP6P35125 1406 aa9.08□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
KCNQ1-204ENST00000380776 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms